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烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務,包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟,為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進實驗平臺,并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP,經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練,對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優(yōu)化,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺,搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,準確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,通過單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,判定空間區(qū)域內(nèi)的細胞類別,精確解析組織空間內(nèi)的異質(zhì)化信息。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復雜疾病研究的測序。西安上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化,還可以實現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您!重慶scRNA空間轉(zhuǎn)錄組多組學測序空間轉(zhuǎn)錄組測序,上海烈冰生物科技很靠譜。
在轉(zhuǎn)錄組學領(lǐng)域,空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學評價為2020年度方法,空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎,它將帶領(lǐng)組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄測序,這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?,F(xiàn)在,新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息,同時還提供空間信息,幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置,進一步擴展到單細胞分辨率,這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀。
基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區(qū)分ATCG;2)3端使用疊氮基團封閉,保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點的熒光,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環(huán)數(shù)的增大會出現(xiàn)不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。
細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生,因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-Seq)在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。杭州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應用推廣,為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。西安上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
機體為響應各種應激,其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況,構(gòu)建細胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。西安上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
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