ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端處理上的主要不同點如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,它從DNA鏈的3'-OH末端逐步切去單核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一種5'→3'核酸外切酶,能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**底物特異性**:-**ExoIII**:適底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于雙鏈DNA切刻位點產生單鏈缺口。由于對單鏈DNA無活性,因此難以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:適底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,對單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低,不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**活性差異**:-**ExoIII**:對具有3'-突出末端(至少有4個堿基,且具有3'-末端C殘基)的DNA、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無活性。-**Lambda核酸外切酶**:對5'-OH端的切割速度比5'-P端慢約20倍;對單鏈DNA的酶切速度比雙鏈DNA慢約100倍。4.**應用場景**:-**ExoIII**:可以用于生產特定方向的單鏈DNA,將線性化DNA設計成為一端為不切割末端(3'突出端),另一端則設計為易切割末端(平端或5'突出端)。
Cre重組酶在基因編輯中的操作主要涉及以下幾個步驟:1.**識別與結合**:-Cre重組酶首先識別并分別結合兩個LoxP序列的兩個反向重復序列,形成一個二聚體。2.**四聚體形成**:-兩個二聚體互相靠近,形成由四個Cre分子與兩個LoxP位點結合形成的四聚體復合物。3.**DNA切割與交換**:-Cre重組酶在每個LoxP位點的間隔序列中引導單鏈切割,產生帶有3’端羥基的斷裂。每個LoxP位點的兩個單鏈分別被切割。切割產生的自由3’端與對側的3’端進行交換和重連,形成Holliday交叉結構。4.**分子重組與解旋**:-Holliday交叉結構通過Cre酶的作用被解旋并重組,形成新的重組產物。這個過程導致兩個LoxP位點之間的DNA序列被刪除、反轉或易位,具體效果取決于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**條件性基因編輯**:-通過建立特異性Cre小鼠,該小鼠中的Cre重組酶由特定啟動子驅動,可在特定細胞或組織或全身表達Cre重組酶。與帶有Lox位點的Flox小鼠雜交,子代中可以獲得既帶有Cre又帶有Flox基因的小鼠,實現(xiàn)條件性基因打靶(表達或敲除靶基因)。Recombinant Mouse CD161 Protein,His TagCas12a同源物能夠識別更簡單的PAM序列(如5-TTN),這使得基因組的覆蓋率顯著提高。
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種常用于分子生物學實驗的酶,特別是在等溫DNA擴增技術中。以下是一些關于BstDNAPolymerase,LargeFragment的關鍵信息:1.**來源**:這種酶來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),是一種熱穩(wěn)定的DNA聚合酶。2.**活性**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有5'到3'的DNA聚合酶活性,并且具有鏈置換活性,這使得它能夠用于等溫擴增反應,如環(huán)介導等溫擴增(LAMP)。3.**熱穩(wěn)定性**:由于其嗜熱特性,BstDNAPolymerase,LargeFragment能夠在較高的溫度下保持活性,通常在60-65°C。4.**應用**:-**等溫擴增**:用于LAMP和其他等溫擴增技術,這些技術不需要傳統(tǒng)的熱循環(huán)儀。-**全基因組擴增**:用于快速擴增少量DNA樣本,以進行進一步的分析。-**突變檢測**:在某些情況下,用于檢測特定基因的突變。5.**優(yōu)點**:-**高保真度**:與某些其他DNA聚合酶相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment具有較高的保真度。-**快速擴增**:等溫擴增技術可以在短時間內快速產生大量DNA。
提取的病毒核酸可以直接用于多種實驗,主要包括:1.**實時熒光定量PCR(qPCR)**:這是一種常用的技術,可以對病毒核酸進行定量檢測。它通過實時監(jiān)測PCR過程中的熒光信號來確定病毒核酸的數(shù)量。例如,病毒核酸檢測就是基于此技術,通過設計特異性引物和探針,對病毒的靶基因進行定性檢測。2.**逆轉錄PCR(RT-PCR)**:這項技術用于檢測RNA病毒,通過將病毒RNA逆轉錄成cDNA,然后進行PCR擴增,以檢測病毒的存在。RT-PCR技術靈敏而且用途廣,可以用于檢測細胞、組織中RNA病毒的含量。3.**等溫擴增法**:包括環(huán)介導的等溫擴增(LAMP)和切口延伸等溫擴增(NEAR),這些方法在恒溫條件下進行,無需復雜的設備,適用于快速、現(xiàn)場的病毒核酸檢測。4.**數(shù)字PCR(dPCR)**:這是一種高度靈敏的技術,可以對病毒核酸進行定量。它通過將樣本分配到成千上萬的微小反應室中,每個反應室單獨進行PCR擴增,從而實現(xiàn)對病毒核酸的精確計數(shù)。5.**核酸雜交技術**:如熒光原位雜交(FISH),可以用于檢測特定病毒核酸序列在細胞或組織中的存在和定位。CRISPR-Cas12a(以前稱為Cpf1)是一種類II型V型內切酶,偏好富含胸腺嘧啶的原間隔短回文重復序列鄰近基序。
在比較BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶對于復雜DNA片段擴增的適用性時,以下是一些關鍵點:1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高熱穩(wěn)定性和擴增效率而被應用于常規(guī)PCR。它擴增速度為30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,無校正功能,易產生錯配堿基。-對于結構復雜的模板,如GC含量高、有二級結構等,TaqPlus可以用于擴增,能有效地擴增10kb以下的片段。-有產品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通過基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具備更強大的擴增性能,適合擴增高度復雜的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高適溫度,能夠適應更加苛刻的擴增條件,同時消除DNA二級結構,因而能夠準確并且均勻地擴增全基因組序列。-BstDNA聚合酶大片段能夠優(yōu)先擴增短片段的DNA,并且能夠確保擴增得到的DNA覆蓋了整個基因組,連貫并且無偏地擴增所有的遺傳位點。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,擴增速度高達10秒/kb,擴增目的片段長達13kb,具有極強的擴增效率的模板適應性,非常適合復雜模板的高保真擴增。
Hifair? Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit :適用于從總RNA或mRNA模板合成鏈cDNA,具有高熱穩(wěn)定性。DL200 DNA Marker
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學實驗中都是常用的酶,但它們之間存在一些關鍵的不同點:1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫擴增,如LAMP技術,無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯誤,但保真性相對較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫擴增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴增的應用中。3.**應用領域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術,適用于各種DNA片段的擴增,包括復雜模板和長片段的擴增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫擴增技術,如LAMP,這些技術不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴增。4.**擴增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫擴增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴增速度和更高的產量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應中。