代謝組學(xué)研究方法：代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物。從本質(zhì)上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個(gè)體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰，然后了解不同化合物的結(jié)構(gòu)，建立一套完備的識(shí)別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析（metabolomic profiling）,研究人員假定了一條特定的代謝途徑，并對(duì)此進(jìn)行更深入的研究。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)重要的分支，與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢(shì)。常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域

代謝組學(xué)：代謝組學(xué) （metabolomics）的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。是對(duì)某一生物或細(xì)胞中相對(duì)分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科。代謝組作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分，在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。 代謝產(chǎn)物是基因表達(dá)的產(chǎn)物，在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質(zhì)相比，代謝產(chǎn)物較小，但是不能形成代謝產(chǎn)物的細(xì)胞是死細(xì)胞，因此不能小看代謝產(chǎn)物的重要性。 研究人員通過對(duì)機(jī)體代謝產(chǎn)物的深入研究，可以判斷機(jī)體是否處于正常狀態(tài)，而對(duì)基因和蛋白質(zhì)的研究都無法得出這樣的結(jié)論。事實(shí)上，代謝組學(xué)研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類疾病，如糖尿病、肥胖癥，代謝綜合癥。目前，已經(jīng)研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(huán)（TCA），糖酵解，花生四烯酸 （AA）/炎癥途徑。杭州個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)定性分析代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機(jī)研究。

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)？實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)，有以下幾個(gè)方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此，一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備，以減少人為的誤差。2）檢測(cè)之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能，可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài)，推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個(gè)項(xiàng)目開始之前，先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測(cè)，確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3）后期數(shù)據(jù)矯正，特別是對(duì)于大樣本項(xiàng)目。我們可以在檢測(cè)序列中加入隨行質(zhì)控樣本（每個(gè)樣品取少量后混合），在后期數(shù)據(jù)處理時(shí)，使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對(duì)整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正。

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)？生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量（如相同劑量給藥后2小時(shí)的小鼠采集并且相同儲(chǔ)存條件和處理方法血清樣本）。相較于基因和蛋白，代謝物處于生命活動(dòng)的下游，收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大，生物學(xué)重復(fù)少可能會(huì)放大組內(nèi)差異對(duì)于整體差異的影響，進(jìn)而影響結(jié)果（如準(zhǔn)確和足夠多的找出生物標(biāo)志物）。因此根據(jù)不同的生物類型，需要不同的生物學(xué)重復(fù)來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。

代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合，樣本采集需要注意什么？絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有：臨床和動(dòng)物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液；細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液；植物的根、莖、葉、花等。代謝每時(shí)每刻都在發(fā)生變化，我們需要研究的是某個(gè)或多個(gè)瞬時(shí)狀態(tài)，因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的，采集后通過低溫淬滅（如液氮淬滅或低溫凍存等）的方法阻止離體后的樣本的代謝活動(dòng)。另外，不同的檢測(cè)要求也需要配合不同的收集方法，具體步驟請(qǐng)參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物（MW<1000）。深圳常規(guī)靶向代謝組學(xué)服務(wù)

代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游。常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域

什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)？(1) 非靶向代謝組學(xué)（Untargeted metabolomics）即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)，無偏向性地對(duì)所有小分子代謝物（一般相對(duì)分子量小于1000）同時(shí)進(jìn)行檢測(cè)分析的代謝組學(xué)。(2) 靶向代謝組學(xué)（Trgeted metabolomics）則為目標(biāo)性代謝組學(xué)，著重對(duì)于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進(jìn)行定性、量檢測(cè)分析和研究。相比于其他組學(xué)，代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢(shì)？系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)重要的分支，與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢(shì)，主要體現(xiàn)在以下幾點(diǎn)：(1) 基因與蛋白質(zhì)表達(dá)的微小變化會(huì)在相應(yīng)代謝物水平上得到放大，更容易被檢測(cè)。(2) 代謝物的種類要遠(yuǎn)小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。常規(guī)靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域

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