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四川植物靶向代謝組學(xué)定量分析

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-07

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些?1、疾病機(jī)制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機(jī)制的研究。5、藥物毒性評價(jià)。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達(dá)到fM級。另外,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學(xué)性質(zhì)不同,質(zhì)譜的離子化效率、信號響應(yīng)強(qiáng)度會(huì)差異很大。物質(zhì)的檢測靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān),化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質(zhì),可能一個(gè)能檢測出來,另一個(gè)檢測不出來。代謝組學(xué)在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。四川植物靶向代謝組學(xué)定量分析

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)?生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量(如相同劑量給藥后2小時(shí)的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動(dòng)的下游,收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大,生物學(xué)重復(fù)少可能會(huì)放大組內(nèi)差異對于整體差異的影響,進(jìn)而影響結(jié)果(如準(zhǔn)確和足夠多的找出生物標(biāo)志物)。因此根據(jù)不同的生物類型,需要不同的生物學(xué)重復(fù)來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。哈爾濱LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)代謝組學(xué)是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律。

代謝組學(xué)是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)的末端。以人體為例,對基因序列信息研究是基因組學(xué)的范疇。轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究基因在外在或內(nèi)在環(huán)境刺激下不同的表達(dá)?;蛐畔⒎g成蛋白質(zhì)后,各種蛋白的形狀、功能、相互關(guān)系是蛋白組學(xué)的研究范疇。各種營養(yǎng)物質(zhì)經(jīng)過人體的消化、代謝后的代謝物,就是代謝組學(xué)的研究范圍。

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機(jī)研究。

代謝組學(xué)樣本收集植物組織:葉片、莖、花:1)取整片葉片/一段莖/一朵花,放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記,迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中(每組一袋),在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3)迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意:(1)采集葉片樣本時(shí),在中午光照好的時(shí)間收集。(2)采集樣本時(shí)保持樣本一致性,尤其是同一組樣本(顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等)。根:1)取整株植物的根部,迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營養(yǎng)液等;2)吸水紙吸干水分后,分裝為500 mg/管;3)標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min,-80 ℃凍存,干冰寄送。與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費(fèi)用更低。四川非靶向代謝組學(xué)

代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000)。四川植物靶向代謝組學(xué)定量分析

代謝組學(xué)樣本收集植物組織:果實(shí)、種子:1)對于含水量高、體積較大的果實(shí)(番茄、西瓜、蘋果等)需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)對于細(xì)小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3)對于要求對整個(gè)果實(shí)進(jìn)行提取的(整粒葡萄等),需要把果實(shí)裝在50 mL離心管/自封袋中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min,-80 ℃凍存,干冰寄送。四川植物靶向代謝組學(xué)定量分析

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