Label Free 非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)優(yōu)點(diǎn):無需標(biāo)記,比較大程度的保留樣本的真實(shí)性;可以區(qū)分“有”、“無”蛋白;不受標(biāo)簽數(shù)量的限制,多個(gè)樣本可以同時(shí)進(jìn)行蛋白定量分析;不同物種和不同的樣本類型可以同時(shí)開展蛋白定量分析;處理步驟簡(jiǎn)單,成本低。 DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué):數(shù)據(jù)非依賴性采集(DIA)是一種明顯提升蛋白質(zhì)組學(xué)研究通量和可重復(fù)性的技術(shù)。經(jīng)典的 DIA 流程通常依賴于 DDA 譜圖庫的構(gòu)建,需要消耗大量的樣品,且周期長(zhǎng),成本高。越來越多的不依賴于 DDA 建庫的分析方法相繼誕生。蛋白質(zhì)組意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”,即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。四川醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)價(jià)格
我們究竟怎么研究蛋白質(zhì)組學(xué)呢?抗體免疫的方法呢,其實(shí)就是ELISA,Western及蛋白質(zhì)芯片。通過合成大量蛋白質(zhì)特異的抗體,能夠進(jìn)行定性檢測(cè)及相對(duì)定量分析,只要你有好用的抗體,那么就可以通過免疫反應(yīng)讓抗體快速的識(shí)別你感興趣的蛋白質(zhì),然后用例如HRP發(fā)光等標(biāo)記方法顯示它們是否存在于你的樣品當(dāng)中?,F(xiàn)在已有的抗體不只能識(shí)別特定蛋白質(zhì),還能識(shí)別特定修飾的特定蛋白質(zhì)或者被特定修飾過的特定蛋白質(zhì)Motif。蛋白質(zhì)組與基因組相對(duì)應(yīng),也是一個(gè)整體的概念。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程蛋白質(zhì)組學(xué)的研究是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時(shí)代的特征。
蛋白組學(xué)技術(shù):蛋白質(zhì)組學(xué)研究的首要任務(wù)是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠、有效的技術(shù)。為達(dá)到這一要求,就需要樣品準(zhǔn)備、數(shù)據(jù)獲取標(biāo)準(zhǔn)化及自動(dòng)化,也就是要有可重復(fù)的高通量的技術(shù)。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)手段在不斷完善,其工作流程,包括蛋白質(zhì)樣本的制備、分離、定量及鑒定。由雙向凝膠電泳、質(zhì)譜技術(shù)、酵母雙雜交系統(tǒng)、蛋白質(zhì)微陣列技術(shù)、能進(jìn)行大規(guī)模數(shù)據(jù)處理的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)和軟件、軟電離技術(shù)及生物信息學(xué)技術(shù)構(gòu)成了蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要技術(shù)體系。其中蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)中的質(zhì)譜技術(shù)是現(xiàn)在比較常用的一種蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)。
蛋白組學(xué)研究怎么做?PRM:平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù),能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進(jìn)行選擇性檢測(cè),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行一定定量,因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的WesternBlot(LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB)。PRM技術(shù)基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺(tái),首先利用四級(jí)桿質(zhì)量分析器的選擇能力,用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子,隨后在Collisioncell中對(duì)母離子進(jìn)行碎裂,之后利用Orbitrap分析器在二級(jí)質(zhì)譜中檢測(cè)所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對(duì)復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行準(zhǔn)確地特異性分析。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平。
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù):生物質(zhì)譜:生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中比較重要的鑒定技術(shù),其基本原理是樣品分子離子化后,根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比(M/E)的差異來分離并確定分子量。對(duì)于經(jīng)過雙向電泳分離的目標(biāo)蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對(duì)這些肽段用質(zhì)譜進(jìn)行鑒定與分析。目前常用的質(zhì)譜包括兩種:基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質(zhì)譜(ESI-MS)。蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ),也能為眾多種疾病機(jī)理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)在應(yīng)用中,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程
蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的?四川醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)價(jià)格
4D定量蛋白質(zhì)組學(xué) :目前,蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時(shí)間(retention time)、質(zhì)荷比(m/z)、離子強(qiáng)度(intensity)這三個(gè)維度對(duì)肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量,即3D蛋白質(zhì)組學(xué)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據(jù)離子的形狀和截面對(duì)離子進(jìn)行分離,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號(hào)能夠被區(qū)分和識(shí)別出來。蛋白質(zhì)組學(xué)分析策略:蛋白質(zhì)組學(xué)分析包括分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能、翻譯后修飾情況、蛋白質(zhì)定位、蛋白質(zhì)表達(dá)情況以及蛋白質(zhì)間的相互作用等等?;诓煌姆治鰞?nèi)容可以采用不同的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)和分析策略。四川醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)價(jià)格