蛋白組學(xué)研究怎么做？PRM:平行反應(yīng)監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù)，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現(xiàn)對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行一定定量，因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技術(shù)基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子，隨后在Collisioncell中對母離子進行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行準(zhǔn)確地特異性分析。蛋白質(zhì)組學(xué)，指對某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究。貴州PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略：自中而下：自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法，分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時，通常需要將被檢測蛋白質(zhì)消化成3-9kDa范圍內(nèi)的肽段，因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是，由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾，自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下：自上而下技術(shù)可以直接對完整的蛋白質(zhì)進行測序，包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大的蛋白質(zhì)片段，而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關(guān)的信息，使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。廣東定量蛋白組學(xué)應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)為農(nóng)業(yè)作物的進一步開發(fā)利用提供巨大的參考價值。
非標(biāo)定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化，認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進行定量。按照其原理主要分為兩種，第1種spectrumcounts類的非標(biāo)記方法，發(fā)展比較早，已經(jīng)形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎(chǔ)，各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標(biāo)記定量的原理是以MS1為基礎(chǔ)，計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。
蛋白質(zhì)組學(xué)的目標(biāo)是要回答關(guān)于蛋白質(zhì)的4個方面的問題:①細(xì)胞中蛋白質(zhì)的含量。②定位。③活性。④修飾。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法主要有:①蛋白質(zhì)雙向電泳。②氨基酸序列測定（包括N端測序和C端測序)。③質(zhì)譜。④生物信息學(xué)。發(fā)育蛋白質(zhì)組學(xué)指在某一特定的生長發(fā)育時期，在特定的生長條件下，特定的細(xì)胞、組織中所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。發(fā)育蛋白質(zhì)組學(xué)揭示了在每個特定時期所表達(dá)的蛋白質(zhì)和這些不同的蛋白質(zhì)在特殊的生長時期可能發(fā)揮的作用，是進一步了解和深入研究蛋白質(zhì)功能的基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。
蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域：1.蛋白質(zhì)鑒定：能夠應(yīng)用一維電泳和二維電泳并分離相關(guān)的技術(shù)，應(yīng)用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)停止審定研討。2.修飾：很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要閱歷后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。修飾是蛋白質(zhì)調(diào)理功用的重要方式，因而對蛋白質(zhì)后修飾的研討對說明蛋白質(zhì)的功用具有重要作用。3、蛋白質(zhì)功用：如剖析酶活性和酶底物，細(xì)胞因子的生物剖析/配基-受體分離剖析。能夠應(yīng)用基因敲除和反義技術(shù)剖析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功用。另外對蛋白質(zhì)表達(dá)出來后在細(xì)胞內(nèi)的定位研討也在水平上有助于蛋白質(zhì)功用的理解。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究主要促進分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。杭州高通量蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有飛行時間質(zhì)譜。貴州PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
蛋白質(zhì)組學(xué)研究內(nèi)容：1.蛋白質(zhì)鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合相關(guān)技術(shù)，利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)進行鑒定研究。2.翻譯后修飾：很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的重要方式，因此對蛋白質(zhì)翻譯后修飾的研究對闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。3.蛋白質(zhì)功能確定：如分析酶活性和確定酶底物，細(xì)胞因子的生物分析/配基-受體結(jié)合分析?？梢岳没蚯贸头戳x技術(shù)分析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功能。另外對蛋白質(zhì)表達(dá)出來后在細(xì)胞內(nèi)的定位研究也在一定程度上有助于蛋白質(zhì)功能的了解。有的熒光蛋白表達(dá)系統(tǒng)就是研究蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)定位的一個很好的工具。貴州PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定