蛋白質(zhì)修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性,從而檢測蛋白質(zhì)或者多肽上位點發(fā)生何種修飾??蓹z測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙?;⒍□;?、丙二酰化、戊二?;?、琥珀?;渭谆?、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉(zhuǎn)導、細胞周期、生長發(fā)育機理等;2、糖基化:蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應答等;3、乙?;夯虮磉_調(diào)控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等;4、泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復以及信號轉(zhuǎn)導等;5、甲基化:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;6、丙?;?/ 丙二?;?/ 戊二酰化 / 琥珀?;褐饕嬖谟诰€粒體和細菌中,與代謝過程密切相關(guān)。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。深圳蛋白質(zhì)氧化修飾組學主要方式
蛋白翻譯后修飾檢測:由于PTMs在基礎(chǔ)生物學以及疾病發(fā)病機理中的重要性,因此非常需要對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進行檢測。對蛋白翻譯后修飾進行研究時通常需要富集步驟,因為這些翻譯后修飾的蛋白質(zhì)相對含量較低。大多數(shù)PTMs的檢測方法與富集策略結(jié)合在一起開發(fā),以提供比較好的機會來識別、驗證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質(zhì)時,可能不需要富集步驟。質(zhì)譜技術(shù),通過測定肽段的分子量可以對該肽段的翻譯后修飾情況進行檢測,并可以對翻譯后修飾蛋白進行定性和定量分析。廣州蛋白質(zhì)甲基化修飾組學研究質(zhì)譜可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù):技術(shù)優(yōu)勢特點。1、 檢測特異性高。2、能夠特異鑒定單個磷酸化位點。同位素標記(Isotope Labeled)結(jié)合免疫印跡法:此方法的原理是當?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時,放射性32P的摻入和分子質(zhì)量變化引起的凝膠遷移(gelshift),再通過免疫印跡方法檢測同位素標記,從而達到鑒定磷酸化蛋白的目的。技術(shù)優(yōu)勢特點:1、檢測技術(shù)靈敏并且直觀。2、常用于體外磷酸化反應結(jié)果檢測。3、 磷酸化鑒定不受抗體限制。4、可同時分析多個蛋白磷酸化。
翻譯后修飾蛋白組學分析:蛋白質(zhì)組學的研究的工作不只聚焦于細胞不同生長時期或是疾病條件下的蛋白質(zhì)表達水平變化,許多至關(guān)重要的生命進程不只由蛋白質(zhì)相對豐度控制,更重要的是被時空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調(diào)控,因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質(zhì)復雜多樣的生物功能的一個重要前提。蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時其分子質(zhì)量會發(fā)生響應的改變,通過質(zhì)譜能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量。同時,發(fā)生翻譯后修飾的蛋白質(zhì)再樣本中含量低且動態(tài)范圍廣,所以在質(zhì)譜檢測前需要對發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段進行富集。質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測的常用技術(shù)之一。
翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個細胞過程的重要方式,幾乎在每個細胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。因此,要在蛋白質(zhì)組學的范圍內(nèi)表征翻譯后修飾蛋白,純化方法是必要的,以分離修飾蛋白和肽段,然后再進行后續(xù)分析。后續(xù)分析一般采用質(zhì)譜技術(shù)進行,可以對翻譯后修飾蛋白組進行定性和定量研究。蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術(shù)優(yōu)點:能夠特異鑒定單個磷酸化位點。貴陽亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學類型
泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位。深圳蛋白質(zhì)氧化修飾組學主要方式
蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢:1. WB方法簡便,多數(shù)實驗室具備Western Blot設(shè)備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質(zhì)譜儀,如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白,將含有目標蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。深圳蛋白質(zhì)氧化修飾組學主要方式
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