代謝組學需要多少的生物學重復？生物學重復指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量（如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本）。相較于基因和蛋白，代謝物處于生命活動的下游，收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大，生物學重復少可能會放大組內(nèi)差異對于整體差異的影響，進而影響結(jié)果（如準確和足夠多的找出生物標志物）。因此根據(jù)不同的生物類型，需要不同的生物學重復來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學的研究方法與蛋白質(zhì)組學的方法類似。代謝組學是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律。LC-MS／MS非靶向代謝組學定量分析

什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學？(1) 非靶向代謝組學（Untargeted metabolomics）即非目標代謝組學或發(fā)現(xiàn)代謝組學，無偏向性地對所有小分子代謝物（一般相對分子量小于1000）同時進行檢測分析的代謝組學。(2) 靶向代謝組學（Trgeted metabolomics）則為目標性代謝組學，著重對于設定好的目標代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學，代謝組學有哪些特殊的優(yōu)勢？系統(tǒng)生物學有基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白組學和代謝組學。代謝組學作為系統(tǒng)生物學的一個重要的分支，與其他組學相比有著其特有的優(yōu)勢，主要體現(xiàn)在以下幾點：(1) 基因與蛋白質(zhì)表達的微小變化會在相應代謝物水平上得到放大，更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關性。上海農(nóng)學靶向代謝組學主要技術代謝組學是繼基因組學、蛋白質(zhì)組學、轉(zhuǎn)錄組學后出現(xiàn)的新興“組學”。

代謝組學在系統(tǒng)生物學中有什么作用？它的地位如何？代謝物作為生物體表型的基礎能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質(zhì)。代謝組學本質(zhì)上是指從整體上研究生物體的代謝物，是對某一生物、組織或細胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進行定性與定量分析的一門科學。代謝組學以指標分析為基礎，高通量檢測為手段，通過研究生物體內(nèi)代謝物的種類與數(shù)量及其變化規(guī)律來闡述機體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過程。代謝組是系統(tǒng)生物學的分支學科之一。其研究內(nèi)容主要包括對代謝物進行定性或定量分析，不同基因型的生物體進行代謝組學表型研究，不同生長環(huán)境及加物理、化學或生物性刺激后個體代謝產(chǎn)物的應答，進行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡解析與轉(zhuǎn)基因評價。

代謝組學樣本收集植物組織：果實、種子：1）對于含水量高、體積較大的果實（番茄、西瓜、蘋果等）需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）對于細小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等)，可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3）對于要求對整個果實進行提取的（整粒葡萄等），需要把果實裝在50 mL離心管/自封袋中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min，-80 ℃凍存，干冰寄送。在食品安全領域，利用代謝組學工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關生物標志物也是一個熱點領域。

代謝組學如何控制臨床樣本的質(zhì)量？對于臨床的樣本建議每組比較低的25個生物學重復，達到30例以上比較好。因為臨床樣本受外界環(huán)境和遺傳背景影響較大，需要很多生物學重復來消除這些外在影響。此外，在樣本收集過程中，應保持收養(yǎng)的時間段和操作程序盡可能一致。代謝組學樣本收集取樣基本原則：表示性和一致性：驗組與對照組樣本在取材部位、時間處理等方面盡可能保持一致，從而保證實驗的可信度；迅速性：操作過程迅速，很大限度縮短樣本采集到實驗的時間；低溫原則：所有樣本離體后，分離步驟應在4℃或冰上進行，分離好的樣本立即存于-80℃，以免樣本產(chǎn)生進一步代謝活動。代謝組學的發(fā)展很迅速。廣東非靶向代謝組學分析方法

代謝組學 （metabolomics）的出現(xiàn)是生命科學研究的必然。LC-MS／MS非靶向代謝組學定量分析

代謝組學比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法：代謝組學分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計分析時，數(shù)據(jù)集通常為一個N × K的矩陣（X矩陣），N表示N個樣本數(shù)，每一行表示一個樣品， K表示K個變量，每一列表示一個變量，在代謝組學中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量，不考慮多個變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡單性、易應用性和可解釋性。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對所測樣品的優(yōu)劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數(shù)變化大小（Fold Change，F(xiàn)C）表示實驗組與對照組的含量比值，可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。LC-MS／MS非靶向代謝組學定量分析

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