1.測序數(shù)據(jù)概況
(1) 原始測序數(shù)據(jù)說明
(2) 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控及統(tǒng)計(jì)
(3) 三代測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2.基因組組裝
3. 基因組組分分析
(1) 編碼基因分析
(2) ORFs掃描及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測
(3) 非編碼RNA分析
4. 基因功能注釋
基因組圈圖
高級分析：
比較基因組分析
1.SNP檢測與注釋
2.Indel檢測與注釋
3.SV檢測
4.基因組共線性分析
5.線粒體與葉綠體基因組片段交流分析
6.共有和特有基因分析
7.系統(tǒng)進(jìn)化分析、選擇壓力分析
定制化生信分析
1.密碼子偏好性分析
2.長重復(fù)序列Long repeat分析
3.簡單重復(fù)序列SSR分析
4.基因表達(dá)量及表達(dá)差異分析（可由客戶提供RNAseq） 小基因組測序的主要特點(diǎn)有很多。重慶動(dòng)植物線粒體基因組小基因組測序多少錢
InDel檢測及注釋：InDel是DNA序列的插入（Insertion）和缺失（Deletion）現(xiàn)象的總稱，狹義的InDel表示1~10bp的短InDel。在基因組編碼區(qū)域，InDel的發(fā)生可能會(huì)引起移碼突變、氨基酸改變、假基因的出現(xiàn)等等現(xiàn)象。這里分析的是狹義的InDel。利用LASTZ軟件將樣品和參考序列進(jìn)行比對，檢測得到初步InDel結(jié)果。然后取參考序列InDel位點(diǎn)上下游150bp與樣品的測序reads用BWA軟件及SAMtools進(jìn)行比對驗(yàn)證，過濾得到可靠的InDel。SV檢測：基因組結(jié)構(gòu)變異（SV，StructuralVariation）通常是指基因組內(nèi)DN**段缺失、插入、重復(fù)、倒位、異位。使用MUMmer軟件對目標(biāo)基因組和參考基因組進(jìn)行比對，再使用LASTZ對區(qū)域間進(jìn)行比對，從區(qū)域比對結(jié)果中查找SV。 云南小基因組測序小基因組測序服務(wù)您知道云生物的小基因組測序系列都有哪些嗎？
迄今為止，已知線粒體基因組*能編碼約20種線粒體膜和基質(zhì)蛋白質(zhì)，并在線粒體自身的核糖體上合成，葉綠體能夠自身編碼合成的蛋白質(zhì)比線粒體多一些，但也*有60多種。然而, 參與組成線粒體和葉綠體的蛋白質(zhì)各有上千種之多，其中絕大多數(shù)的蛋白質(zhì)仍然是由核基因編碼，在細(xì)胞質(zhì)核糖體上合成后轉(zhuǎn)移到線粒體與葉綠體當(dāng)中的。細(xì)胞核與發(fā)育成熟的線粒體或葉綠體之間存在著密切的、準(zhǔn)確的、嚴(yán)格調(diào)控的協(xié)同機(jī)制。也就是說，線粒體和葉綠體的自主程度是有限的，它們對核遺傳系統(tǒng)具有很強(qiáng)的依賴性。所以，線粒體和葉綠體被稱為半自主性細(xì)胞器。
葉綠體和線粒體有自己的基因組、蛋白質(zhì)合成系統(tǒng)和膜系統(tǒng)，說明這兩種細(xì)胞器具有自我繁殖所必須的基本物質(zhì)，能夠進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯，這就保證了它們在真核細(xì)胞中仍然有一定程度的自主性。有關(guān)線粒體遺傳的研究，已經(jīng)清楚地顯示出了線粒體的自主性。通過細(xì)胞的結(jié)合，一種細(xì)胞的線粒體可以在雜種細(xì)胞及其后代的體內(nèi)生活和增殖。不僅一種動(dòng)物的線粒體可以生活在另一種動(dòng)物的細(xì)胞中，而且連葉綠體都可以人工地使它們生活在動(dòng)物細(xì)胞中。例如，在離體的小鼠成纖維細(xì)胞的培養(yǎng)基中加入菠菜葉綠體，半小時(shí)就可以看到有些葉綠體已經(jīng)在小鼠的細(xì)胞中生存。事實(shí)上，葉綠體在***外也能獨(dú)自生存相當(dāng)長的時(shí)間。例如，把刺海松(一種管藻)的葉綠體培養(yǎng)在簡單的無機(jī)培養(yǎng)基中，5d后它們?nèi)匀荒軌蜻M(jìn)行光合作用。 小基因組測序的主要特點(diǎn)都有哪些呢？
industryTemplate細(xì)胞質(zhì)中主要的遺傳物質(zhì)的載體是線粒體和葉綠體。廣東植物葉綠體基因組小基因組測序多少錢
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線粒體與葉綠體相比，線粒體要小一些，直徑0.5?1μm，長1?2μm，通常呈橢球狀或圓柱體。線粒體也由內(nèi)外兩層單位膜包裹，內(nèi)外膜之間有腔。外膜平整光滑，內(nèi)膜內(nèi)折形成嵴。內(nèi)膜上分布有許多規(guī)律排列的帶柄的球狀小體，即ATP合酶，它利用電子傳遞過程中形成的質(zhì)子跨膜電化學(xué)勢梯度合成ATP。線粒體膜的內(nèi)部為基質(zhì)，具有一定的pH和滲透壓，含有進(jìn)行三羧酸循環(huán)等多種代謝途徑的酶。除此之外，線粒體基質(zhì)中還含有自身的DNA、RNA和核糖體。重慶動(dòng)植物線粒體基因組小基因組測序多少錢