Chip-Seq 是指通過染色質免疫共沉淀技術（ChIP）特異性地富集目的蛋白結合的DN**段，并對其進行純化和文庫構建；然后對富集得到的DN**段進行高通量測序，通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區(qū)段信息，是目前在全基因組水平研究蛋白結合靶DNA序列的重要手段，為轉錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學的研究提供有效方法。
應用領域
1、確定組蛋白修飾的位置及其與基因表達的關系。
2、完成對轉錄因子及其它蛋白在基因組上結合位點的精細定位。
3、研究特定的核小體或組蛋白的分布。 云生物提供測序服務。北京WGBS技術服務
雖然焦磷酸測序可以進行單個位點甲基化程度的精確定量，但是目前來看，測序的片段長度還比較短，只有一百多bp，其中有效長度約為60bp。以上是對幾種常用的特異位點甲基化檢測方法進行了介紹及比較，還有一些檢測技術是在常用的檢測手段上進行優(yōu)化或者將不同的方法進行結合應用，比如以MSP方法為基礎，發(fā)展了SMART-MSP技術，該技術利用定量技術對MSP擴增過程進行檢測，同時后續(xù)結合HRM技術來分析甲基化差異。此外，利用質譜平臺進行甲基化檢測的有MALDI-TOF技術，可以對甲基化進行精確檢測并能進行高通量篩選。從對這些技術的比較分析來看，沒中檢測技術都有各自的優(yōu)點，并也存在一定的局限性，研究者可以根據自己的實際研究情況進行選擇。在特異甲基化位點檢測上，能夠提供BSP、HRM及焦磷酸測序三種技術的完整的檢測服務，具有豐富的經驗，幫助客戶加速甲基化研究進程。 廣東單細胞測序技術服務口碑推薦基于高通量測序平臺的甲基化圖譜分析。
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將待測DNA經過亞硫酸鹽處理，通過PCR擴增過程引入T7啟動子序列，經T7DNA聚合酶的體外轉錄過程得到各樣本RNA產物，經堿基特異性酶切處理，得到RNA小片段，并用飛行質譜檢測每個片段的分子量，***EpiTYPER程序完成數據的自動化處理并報告每個檢測片段的甲基化程度。技術優(yōu)勢·檢測片段長：擴增片段長度可達500bp·高靈敏度：可發(fā)現低至5%甲基化水平，樣本起始量低至10ng?！ぶ貜托院茫鹤儺愊禂礐V≤5%。·高性價比：用384孔板進行PCR反應，一個擴增產物可以進行多重CpG位點分析，無需后續(xù)驗證，可直接用于文章發(fā)表。服務內容1.根據客戶提供的序列信息進行預評估；2.進行樣本DNA的分離、純化、質檢及亞硫酸鹽修飾。3.使用特殊設計的一對引物擴增樣本，得到帶有T7RNA聚合酶啟動子序列的擴增產物。4.在體外轉錄體系中，利用T7RNA聚合酶，將擴增產物轉錄為RN**斷。5.利用RNaseA能夠特異性識別并切割RNA中U3’端的特性，將RN**斷切割成攜帶有CpG位點的小片斷。6.使用sequenom®MassArray飛行質譜分析系統(tǒng)檢測產物。由于同一片斷中，只有CpG和CpA之間16Da的分子量差別，即質譜圖中兩者峰的差距。 甲基化驗證是甲基化研究必不可少的一環(huán)。
GOS2基因靶向甲基化測序確定了一種快速復發(fā)、常規(guī)致死的腎上腺皮質*亞型
Targeted Assessment of G0S2
Methylation Identifies a Rapidly Recurrent, Routinely Fatal Molecular Subtype
of Adrenocortical Carcinoma. Clin Cancer Res. 2019; 25(11):3276-3288.
(IF= 10.199)
研究者分析了ACC-TCGA數據，在114例腎上腺皮質**的**隊列中鑒定了一個在CIMP高ACC中***被高甲基化并沉默的基因G0S2，并通過高通量BSP得到驗證。G0S2基因CpG島高甲基化**預測不良臨床后果，是ACC快速復發(fā)或致死的標志。評估G0S2甲基化對臨床決策是直接可行的，并有助于對侵襲性ACC進行有效輔助***。 DNA甲基化多發(fā)生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。遼寧焦磷酸測序技術服務售后服務
DNA甲基化作為表觀遺傳學研究的重要范疇。北京WGBS技術服務
cfDNABS-Seq送樣要求一、送樣類型分離好的血漿二、保存方式分離后的血漿，用ml離心管分裝，例如：1ml/管；放-20℃冰箱中保存（短暫保存，1-2周）；放-80℃冰箱中長期保存(1年以內)；保存期間不能凍融。三、運輸條件干冰運輸：順豐陸運（3-4天時間），夏季10-15公斤干冰；秋冬季10公斤干冰四、抽血要求1、使用Streck**管（不建議使用普通的EDTA-鈉抗凝管），采集10ml外周靜脈血（客戶沒有Streck**管，公司配送）；2、室溫或者放置4℃冰箱中半小時以上，不超過8小時，進行血漿分離步驟五、血漿分離步驟1、4℃條件下以1600g離心10min，離心后將上清（血漿）分裝到2、4℃條件下以16000g離心10min去除殘余細胞，將上清移入新的離心管中，每管分裝1ml;3、血漿樣本存放于-80℃冰箱中保存;使用干冰運輸,提取之前不能凍融。備注1：血漿分離在4℃條件進行，如果客戶沒有冷凍離心機，也可以在室溫條件下進行；備注2：離心后取血漿上清，避免吸取白細胞；通常10ml全血可以獲得4-5ml血漿。 北京WGBS技術服務