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成都烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

來源: 發(fā)布時間:2022-09-18

空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細胞測序的結(jié)果不同,這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達,即無有效Spot位點。同樣的,另一個就是組織切片的大小,也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎質(zhì)量??臻g轉(zhuǎn)錄組測序機構(gòu),請認準上海烈冰生物科技。成都烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

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單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。

烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領域,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領域國際主流學術期刊,已發(fā)表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等??臻g轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析,認準烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺。

所謂的高通量測序技術,又名大規(guī)模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。?,成為目前組學研究的主要技術??臻g轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經(jīng)開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學研究視角。上海BD空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

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作為2019年的明星技術之一,10x Genomics單細胞測序憑借其高通量、低成本、易操作、穩(wěn)定性高等優(yōu)勢一直保持著高熱度,目前利用該平臺發(fā)表的文章已達500多篇??臻g轉(zhuǎn)錄組技術優(yōu)勢:實現(xiàn)基因表達數(shù)據(jù)與空間定位信息的結(jié)合,解析多種類型組織切片樣本中基因表達譜;無需組織解離,保留組織結(jié)構(gòu)及細胞微環(huán)境,鑒定異質(zhì)性組織中細胞類型,避免相關偏好性;可用于挖掘新的組織生物標記物;可與現(xiàn)行實驗室組織分析方法輕松對接,短時間內(nèi)即可完成切片及文庫制備流程。成都烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

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