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北京代謝組學平臺建設

來源: 發(fā)布時間:2022-11-09

GC-MS代謝組學和 LC-MS代謝組學研究:鹽度的變化會影響甲殼類動物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學對青蟹適應鹽度急性下降過程中的代謝變化進行了研究,利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果表明,在急性低鹽脅迫下,青蟹通過甘油磷脂代謝物調(diào)節(jié)生物膜的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,然后通過ABCs轉(zhuǎn)運蛋白運輸氨基酸和碳水化合物,實現(xiàn)細胞內(nèi)外的滲透平衡。此項研究體現(xiàn)了組學技術在機制研究中的重要作用。王春琳課題組深耕青蟹研究,近些年來探索青蟹對環(huán)境的適應變化也在各大期刊上發(fā)表:項目文章|iTRAQ蛋白組學助力寧波大學越冬期間擬穴青蟹代謝變化研究項目文章|兩篇背靠背,王春琳、王歡課題組揭示擬穴青蟹適應鹽度驟降的代謝機理非靶標代謝組學預實驗,周期短,報告快,專業(yè)可信耐。北京代謝組學平臺建設

代謝組學+轉(zhuǎn)錄組學研究:2022年2月,中國海洋大學食品科學與工程學院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學和代謝組學等研究方法,發(fā)現(xiàn)植物乳孢桿菌可以通過AI-2/luxs介導的群體感應(QS)系統(tǒng)來調(diào)節(jié)其生長特性和代謝,該系統(tǒng)是參與食品安全的正調(diào)控因子,這將有助于研究植物乳孢桿菌的生物保護控制潛力,特別是在食品工業(yè)生物技術中的應用。浙江植物代謝組學的研究代謝組學熱圖聚類分析 火山圖 散點圖如何繪制。

雙平臺代謝組學研究,2022年4月,鹿明生物合作客戶中國醫(yī)學科學院醫(yī)藥生物技術研究所李亮課題組在Environmental Pollution期刊發(fā)表了題為“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通過LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了空氣中顆粒物和生物氣溶膠暴露有關的尿液生物標志物,并揭示了循環(huán)暴露于清潔和污染空氣環(huán)境的年輕健康人的尿液代謝特征的動態(tài)變化。鹿明生物技術支持及生信分析同事為該文章做出相應貢獻,為署名作者。

GC-MS非靶向代謝組學等研究方法:2021年10月,廣東石油化工大學環(huán)境科學與工程學院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通過GC-MS非靶向代謝組學等研究方法,發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝,丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數(shù)差異表達的代謝物被下調(diào),表明有機磷阻燃劑對代謝功能和關鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機磷阻燃劑對環(huán)境產(chǎn)生的風險提供了新的見解。讀懂代謝組學 代謝組學的研究范疇。

GC-MS非靶向代謝組學研究,2022年2月,上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發(fā)表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術對香菇菌絲進行定量蛋白質(zhì)組學和代謝組學分析,發(fā)現(xiàn)氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程,并對其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。中文標題:氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色形成的重要過程發(fā)表期刊:FrontiersinMicrobiology影響因子:5.64作者單位:上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所涉及的歐易/鹿明生物服務產(chǎn)品:iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學。代謝組學分析 代謝組學檢測 代謝組學價格 代謝組學數(shù)據(jù)分析流程 。江蘇代謝組學.ppt

歐易生物助力靶向/非靶向代謝組學研究。北京代謝組學平臺建設

非靶向代謝組學研究:利用番茄的自然變異確定番茄復合體中果實多酚的途徑結(jié)構(gòu)和代謝調(diào)控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發(fā)表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學技術:LC-MS靶向代謝組學、GC-MS非靶代謝組(雙平臺代謝組學),本研究通過表征構(gòu)成八種不同番茄多酚代謝網(wǎng)絡的潛在生物合成和修飾反應,闡明了八種番茄復合體多酚生物合成的整個生物合成框架,并對相關代謝物和結(jié)構(gòu)基因進行了詳細注釋,并運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設計提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據(jù)。北京代謝組學平臺建設

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