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山東糖蛋白組學

來源: 發(fā)布時間:2022-11-08

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽(TMT)標記的蛋白質(zhì)組學和平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)技術(shù),對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應(yīng)激生理學檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學 解決方案。山東糖蛋白組學

iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)研究方法:2021年7月,海南大學園藝園林學院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)研究方法,發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累模式特征,探究了不同成熟度油茶轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜機理,描繪了海南油茶種子成熟過程的動態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。上海分泌蛋白的蛋白組學檢測蛋白質(zhì)組學,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。

蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學研究案例:2021年12月30日復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創(chuàng)新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,通過基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學、微生物組學研究方法對262例肝內(nèi)膽管*(iCCA)患者的配對**和*旁組織進行了分析,通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC顯示出抑制脂肪生成酶(ACC,F(xiàn)ASN和SCD1)表達的趨勢,同時***上調(diào)了GLUT2。與對照組相比,AC***增加了PEPCK的表達,兩種化學物質(zhì)對G6Pase均無***影響(圖4A)。PRM蛋白靶向驗證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致,這進一步證實了蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(圖4B)。轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示,處理組的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上調(diào),AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。研究機構(gòu),提供蛋白組學聯(lián)合分析,技術(shù)咨詢服務(wù)。

作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學運用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學、泛素化蛋白質(zhì)組學(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機制。本文的多組學數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。蛋白質(zhì)組學多組學分析蛋白質(zhì)組學研究進展。江西非標定量蛋白組學

蛋白質(zhì)組學,修飾蛋白質(zhì)組,蛋白·修飾·代謝。山東糖蛋白組學

蛋白質(zhì)是生命活動的主要執(zhí)行者,而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價修飾方式之一,真核生物體內(nèi)有超過三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調(diào)節(jié)著包括細胞增殖、發(fā)育、分化、信號轉(zhuǎn)導、細胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮及**發(fā)生等過程在內(nèi)的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析,則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發(fā)揮了更加重要的作用。山東糖蛋白組學

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