Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等標記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針所結(jié)合,再加入抗地高辛或生物素酶標抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,之后酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,若加入內(nèi)標,作出標準曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的。PCR可能是分子生物學中使用很較廣的技術(shù)。莆田實時熒光PCR研究方案引物的設(shè)計注意事項:1,引物設(shè)計要跨內(nèi)含子,不能在一個外顯子上(...
Real-time PCR實驗注意事項-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。3.有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室溫10min,然后用0.1%DEPC水沖洗,晾干。4.配制的溶液應盡可能的用0.1%DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經(jīng)0.22μm濾膜過濾除菌。5.操作人員戴一次性口罩、帽子、手套...
Real-time PCR:對擴增技術(shù)的修飾可以從完全未知的基因組中提取片段,或者可以產(chǎn)生感興趣區(qū)域的單鏈。聚合酶鏈反應有許多應用于傳統(tǒng)的DNA克隆。它可以從更大的基因組中提取片段以插入載體,這可能只有少量可用。使用一組“載體引物”,它還可以分析或提取已經(jīng)插入載體的片段。聚合酶鏈反應方案的一些改變可以產(chǎn)生突變(通用的或定點的)插入片段。聚合酶鏈反應可以選擇這些突變來理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質(zhì)功能。聚合酶鏈式反應:模板的制備,PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA。廈門特殊樣本RT-PCR檢測技術(shù)Real-time PCR:所謂Real-time PCR技術(shù),是指在PCR...
Real-time PCR式反應準備:10×擴增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、TaqDNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實驗調(diào)整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應五要素:參加PCR反應的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細胞內(nèi)DNA復制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設(shè)計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。聚合酶鏈式反應的特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。徐州細胞PCR檢測技術(shù)...
內(nèi)標在傳統(tǒng)定量中的作用,由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,即PCR到達平臺期后進行檢測,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復實驗,所得結(jié)果有很大差異,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。內(nèi)標對定量PCR的影響,若在待測樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標,則PCR反應變?yōu)殡p重PCR,雙重PCR反應中存在兩種模板之間的干擾和競爭,尤其當兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時,這種競爭會表現(xiàn)得更為明顯。但由于待測樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以...
實時熒光定量PCR:實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標準曲線獲得定量結(jié)果。因此,實時熒光定量PCR無需內(nèi)標是建立在兩個基礎(chǔ)之上的:Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,剛剛進入真正的指數(shù)擴增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性極好,即同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內(nèi)擴增,得到的Ct值是恒定的。Real-time PCR可看作是生物體外的特殊DNA復制。鹽城實時PCR檢測技術(shù)Real-time PCR操作流程:1、收集樣品。2相關(guān)試劑...
Real-time PCR:Ct值與起始模板的線性關(guān)系由于Ct值與起始模板的對數(shù)存在線性關(guān)系,可利用標準曲線對未知樣品進行定量測定,因此,實時熒光定量PCR是一種采用外標準曲線定量的方法。外標準曲線的定量方法相比內(nèi)標法是一種準確的、值得信賴的科學方法。利用外標準曲線的實時熒光定量PCR是迄今為止定量較準確,重現(xiàn)性較好的定量方法,已得到全世界的公認,普遍用于基因表達研究、轉(zhuǎn)基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領(lǐng)域。實時熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略,相對定量和定量。由于在PCR擴增的指數(shù)時期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為...
Real-timePCR技術(shù)服務聚合酶鏈式反應的試驗污染:實驗室中克隆質(zhì)粒的污染:在分子生物學實驗室及某些用克隆質(zhì)粒做陽性對照的檢驗室,這個問題也比較常見。因為克隆質(zhì)粒在單位容積內(nèi)含量相當高,另外在純化過程中需用較多的用具及試劑,而且在活細胞內(nèi)的質(zhì)粒,由于活細胞的生長繁殖的簡便性及具有很強的生命力。其污染可能性也很大。污染的監(jiān)測:一個好的實驗室,要時刻注意污染的監(jiān)測,考慮有無污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。重復性試驗。選擇不同區(qū)域的引物進行PCR擴增。電子PCR被提出作為分子生物學的教育工具。徐州組織RT-PCR檢測技術(shù)Real-time PCR從用途上分可以分為定性分...
Real-time PCR鏈反應的常見問題分析與解決方法:反應緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計引物。引物量過多。減少反應體系中引物的用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應
聚合酶鏈式反應的試驗污染:PCR反應的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產(chǎn)生。污染原因:標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染;標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)...
Real-time PCR與普通PCR的實驗目的不同,所以對引物的設(shè)計要求也不同。普通PCR的實驗目的只是為了獲得目的基因產(chǎn)物,允許有非特異擴增,只要目標條帶清晰明亮,就可以通過切膠回收的方法回收目標條帶,之后進行后續(xù)的克隆、測序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進行擴增,只有這樣的擴增后續(xù)由Ct值推算出的起始量模板量才準確,基于此,Real-time PCR對非特異性擴增和引物二聚體的存在有較嚴格的要求。聚合酶鏈式反應中的DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。徐州血液定量PCR供應商所謂real-timeQ-PCR技術(shù),...
為了便于對所檢測樣本進行比較,在real-timeQ-PCR反應的指數(shù)期,首先需設(shè)定一定熒光信號的域值,一般這個域值(threshold)是以PCR反應的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號(baseline),熒光域值的缺省設(shè)置是3~15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍。如果檢測到熒光信號超過域值被認為是真正的信號,它可用于定義樣本的域值循環(huán)數(shù)(Ct)。Ct值的含義是:每個反應管內(nèi)的熒光信號達到設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標準品可作出標準曲線,因此只要獲得未知樣品的Ct值,即...
Real-timePCR的反應條件:dNTP濃度過高會加快反應速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環(huán)的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時退火溫度。聚合酶鏈反應可以用于分析病癥、微生物或其他疾病狀態(tài)中基...
Real-time PCR反應:多重連接依賴探針擴增(MLPA):允許用單個引物對擴增多個靶標,從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應:由單個PCR混合物中的多個引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴增子。通過同時靶向多個基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時間來執(zhí)行。每個引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個反應中正確工作,并符合擴增子尺寸。也就是說,當通過凝膠電泳可視化時,它們的堿基對長度應該足夠不同以形成不同的條帶。Real-time PCR反應的一個主要限制是,為了產(chǎn)生其選擇性擴增的引物,需要目標序列的先前信息。杭州組織數(shù)字PCR原理及步驟...
引物的設(shè)計對于這個實驗至關(guān)重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設(shè)計的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結(jié)果導致實驗結(jié)果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結(jié)果誤差很大,不可信)。流聚合酶鏈反應:一種偽等溫PCR方法。常州實時數(shù)字PCR研究方案聚合酶鏈式反應:因為PCR擴增了目的DNA...
Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結(jié)構(gòu)使核酸從蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復合物:由氧化釩離子和核苷形成的復合物,它和RNA酶結(jié)合形成過渡態(tài)類物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,...
實時熒光定量PCR:實時熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限,實現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度,并記錄在電腦軟件之中,通過對每個樣品Ct值的計算,根據(jù)標準曲線獲得定量結(jié)果。因此,實時熒光定量PCR無需內(nèi)標是建立在兩個基礎(chǔ)之上的:Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達Ct值所在的循環(huán)數(shù)時,剛剛進入真正的指數(shù)擴增期(對數(shù)期),此時微小誤差尚未放大,因此Ct值的重現(xiàn)性極好,即同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內(nèi)擴增,得到的Ct值是恒定的。聚合酶鏈式反應的引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。鹽城血液熒光PCR所謂real-timeQ-PCR技術(shù),是指在PCR反應體...
Real-time PCR鏈反應:嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景,提高DNA擴增的特異性。兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。在個反應中,一對引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應,所述引物的結(jié)合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細的目標序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)...
聚合酶鏈式反應的試驗污染:PCR擴增產(chǎn)物污染:這是PCR反應中很主要很常見的污染問題。因為PCR產(chǎn)物拷貝量大(一般為1013拷貝/ml),遠遠高于PCR檢測數(shù)個拷貝的極限,所以極微量的PCR產(chǎn)物污染,就可形成假陽性。還有一種容易忽視,很可能造成PCR產(chǎn)物污染的形式是氣溶膠污染。在空氣與液體面摩擦時就可形成氣溶膠,在操作時比較劇烈地搖動反應管,開蓋時、吸樣時及污染進樣的反復吸樣都可形成氣溶膠而污染。據(jù)計算一個氣溶膠顆??珊?8000拷貝,因而由其造成的污染是一個值得特別重視的問題。在嵌套聚合酶鏈反應中,除了預期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。南通血液熒光PCR哪家好聚合酶鏈式...
聚合酶鏈式:PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構(gòu)成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備;模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈...
聚合酶鏈式反應:Taq(水生棲熱菌)聚合酶耐熱DNA聚合酶的很好活性溫度約為75-80°C(167-176°F),盡管該酶通常使用72°C(162°F)的溫度。在該步驟中,DNA聚合酶通過從反應混合物中添加在5’-至-3’方向上與模板互補的游離DNA鏈來合成與DNA模板鏈互補的新DNA鏈,在新生(伸長)DNA鏈的末端,將dNTPs的5'-磷酸基與3'-羥基縮合。延伸所需的精確時間取決于所使用的DNA聚合酶和要擴增的DNA目標區(qū)域的長度。根據(jù)經(jīng)驗,在很好溫度下,大多數(shù)DNA聚合酶每分鐘聚合一千個堿基。在很好條件下(即,如果沒有限制底物或試劑的限制),在每個延伸/延伸步驟中,DNA靶序列的數(shù)量加倍...
聚合酶鏈反應:多重連接依賴探針擴增(MLPA):允許用單個引物對擴增多個靶標,從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應:由單個PCR混合物中的多個引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴增子。通過同時靶向多個基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時間來執(zhí)行。每個引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個反應中正確工作,并符合擴增子尺寸。也就是說,當通過凝膠電泳可視化時,它們的堿基對長度應該足夠不同以形成不同的條帶。聚合酶鏈反應是一種非常強大和實用的研究工具。徐州實時熒光定量PCR網(wǎng)站聚合酶鏈式反應的常見問題:靶序列或擴增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一...
聚合酶鏈式反應的試驗污染:PCR反應的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產(chǎn)生。 污染原因:標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染;標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。序列間特異性聚合酶鏈反應是一種用于DNA指紋識別的聚合酶鏈反應方法。廈門骨頭PCR...
聚合酶鏈反應:流聚合酶鏈反應:一種偽等溫PCR方法。將溶液置于熱梯度下,而不是反復加熱和冷卻聚合酶鏈反應混合物。由此產(chǎn)生的熱不穩(wěn)定性驅(qū)動對流流動自動將聚合酶鏈反應試劑從熱區(qū)域和冷區(qū)域打亂,從而反復啟動聚合酶鏈反應。通過利用混沌流場的出現(xiàn),可以優(yōu)化熱邊界條件和PCR外殼的幾何形狀等參數(shù),以產(chǎn)生特異和快速的PCR。這種對流聚合酶鏈反應設(shè)置明顯降低了設(shè)備功率需求和操作時間。逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應):用于從RNA中擴增DNA。逆轉(zhuǎn)錄酶將核糖核酸逆轉(zhuǎn)錄成cDNA ,然后通過聚合酶鏈反應進行擴增。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列,包括轉(zhuǎn)錄起始和...
聚合酶鏈式反應的試驗污染:陽性對照:在建立PCR反應實驗室及一般的檢驗單位都應設(shè)有PCR陽性對照,它是PCR反應是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個重要的參考標志。陽性對照要選擇擴增度中等、重復性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標本,如以重組質(zhì)粒為陽性對照,其含量宜低不宜高(100個拷貝以下)。但陽性對照尤其是重組質(zhì)粒及高濃度陽性標本,其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大。因而當某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定,檢驗人員心中有數(shù)時,在以后的實驗中可免設(shè)陽性對照。陰性對照:每次PCR實驗務必做陰性對照。它包括:標本對照:被檢的標本是血清就用鑒定后的正常血清作對照;被檢的標本是組織細胞就用相應的組...
聚合酶鏈式反應:三步:變性:模板DNA加熱變性;復性,引物與它的靶序列發(fā)生退火,引物DNA量多,使引物和模板在局部形成雜交鏈;延伸,4種dNTP 與 Mg2+ 存在的條件下,DNA合成酶催化以引物為起始點,按5'-3'方向進行延伸。上面三步為一個循環(huán),可使拷貝數(shù)到達2*E-6-2*E-7。PCR產(chǎn)物一段雙鏈DNA,是由它的末端引物的5’端決定的。首輪擴增,其產(chǎn)物是大小不均一的DNA分子。長度應大于兩引物之間的長度。在第二個循環(huán)中,由于5'固定,其產(chǎn)物長度就由等于兩引物之間的長度。所以幾十個循環(huán)后就會產(chǎn)生大量的兩引物之間序列。像所有酶一樣,DNA聚合酶也容易出錯,這反過來會導致產(chǎn)生的PCR片段發(fā)...
聚合酶鏈反應也可以用作以下敏感試驗的一部分組織分型,對移植至關(guān)重要。截至2008年,甚至有人提議用聚合酶鏈反應檢測取代傳統(tǒng)的血型抗體檢測。許多形式的病癥涉及致病基因的改變。通過使用基于聚合酶鏈反應的測試來研究這些突變,醫(yī)治方案有時可以根據(jù)患者的不同而不同。聚合酶鏈反應可以早期診斷惡性疾病,如白血病和淋巴瘤,這是目前病癥研究中發(fā)展很快的,并且已經(jīng)被常規(guī)使用。PCR檢測可以直接在基因組DNA樣品上進行,以檢測易位特異性惡性細胞,其靈敏度至少是其他方法的10,000倍。聚合酶鏈反應在醫(yī)學領(lǐng)域非常有用,因為它允許分離和擴增病癥抑制劑。例如,定量PCR可以用于量化和分析單細胞,以及識別DNA、mRNA和...
聚合酶鏈式反應:1976年,中國科學家,發(fā)現(xiàn)了穩(wěn)定的Taq DNA聚合酶,為PCR技術(shù)發(fā)展也做出了基礎(chǔ)性貢獻。PCR是利用DNA在體外攝氏95°高溫時變性會變成單鏈,低溫(經(jīng)常是60°C左右)時引物與單鏈按堿基互補配對的原則結(jié)合,標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散再調(diào)溫度至DNA聚合酶很適反應溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補鏈?;诰酆厦钢圃斓腜CR儀實際就是一個溫控設(shè)備,能在變性溫度,復性溫度,延伸溫度之間很好地進行控制。聚合酶鏈式反應中兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避...
聚合酶鏈式反應:模板的制備,PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA。模板的取材主要依據(jù)PCR的擴增對象,可以是病原體標本如病毒、細菌、菌類等。也可以是病理生理標本如細胞、血液、羊水細胞等。法醫(yī)學標本有血斑、精斑、毛發(fā)等。標本處理的基本要求是除去雜質(zhì),并部分純化標本中的核酸。多數(shù)樣品需要經(jīng)過SDS和蛋白酶K處理。難以破碎的細菌,可用溶菌酶加EDTA處理。所得到的粗制DNA,經(jīng)酚、氯仿抽提純化,再用乙醇沉淀后用作PCR反應模板。像所有酶一樣,DNA聚合酶也容易出錯,這反過來會導致產(chǎn)生的PCR片段發(fā)生突變。南京分子生物學定量PCR研究方案聚合酶鏈式反應:RNA和DNA的五碳糖,前者比后者多了一個O...
聚合酶鏈式反應準備:引物內(nèi)部不應出現(xiàn)互補序列。兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。引物3‘端的堿基,特別是很末及倒數(shù)第二個堿基,應嚴格要求配對,很好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。莆田分子生物學熒光PCR原理聚合酶鏈反應的常見問題分析與...