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上海靶向代謝組學(xué)

來源: 發(fā)布時間:2022-01-20

代謝組學(xué)研究方法: 對于代謝產(chǎn)物來說,不只只有質(zhì)譜峰這個特征。更進一步說,質(zhì)譜(MS)并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補色譜的不足。過去,只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進行有意義的比較,研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進行分析。此外,還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)?上海靶向代謝組學(xué)

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些?1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達到fM級。另外,相同含量的不同物質(zhì),由于自身化學(xué)性質(zhì)不同,質(zhì)譜的離子化效率、信號響應(yīng)強度會差異很大。物質(zhì)的檢測靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān),化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質(zhì),可能一個能檢測出來,另一個檢測不出來。上海靶向代謝組學(xué)代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。

代謝組學(xué)樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水?。?℃)凝集至少1h(2h以內(nèi)),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。

靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為:1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標準品。如果無法從市場上買到,就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號,再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進行處理,得到報告。3. 統(tǒng)計分析和解釋 將定量報告輸入統(tǒng)計分析軟件包,用統(tǒng)計工具,如ANOVA,對數(shù)據(jù)進行處理。靶向分析:在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中,要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產(chǎn)生漂移,所以在實驗中,要按隨機順序?qū)颖具M行檢測,且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進行采集,以減少誤差。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。

代謝組學(xué)研究方法:代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物。從本質(zhì)上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰,然后了解不同化合物的結(jié)構(gòu),建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析(metabolomic profiling),研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進行更深入的研究。代謝組學(xué)效仿了基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。河南個性化定制靶向代謝組學(xué)鑒定

代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。上海靶向代謝組學(xué)

代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次:代謝物靶標分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸、有機酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理條件下的動態(tài)變化規(guī)律。上海靶向代謝組學(xué)

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