如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)?實驗設(shè)計先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),有以下幾個方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此,一個項目應(yīng)當(dāng)只由一個人負責(zé)前處理。推薦使用自動衍生設(shè)備,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),推薦使用一組混標作為儀器質(zhì)控。在每一個項目開始之前,先進行質(zhì)控樣檢測,確認氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3)后期數(shù)據(jù)矯正,特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質(zhì)控樣本(每個樣品取少量后混合),在后期數(shù)據(jù)處理時,使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對整體數(shù)據(jù)進行矯正。代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似。南京LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)檢測多少錢
GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度?GC/MS的定性有雙重標準,一是保留指數(shù),二是質(zhì)譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強且穩(wěn)定,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(如NIST庫)進行比對后,我們將會得到一個叫相似度的指標。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值,軟件才會給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標準品質(zhì)譜信息進行完全比對定性,也就是說只有經(jīng)過標準品比對,代謝物才是被100%定性。深圳靶向代謝組學(xué)檢測多少錢代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疾病早期診斷。
代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標志物也是一個熱點領(lǐng)域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR),質(zhì)譜(MS),色譜(HPLC,GC),其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結(jié)合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關(guān)的生物標志物(biomarker)。
代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)?生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量(如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動的下游,收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大,生物學(xué)重復(fù)少可能會放大組內(nèi)差異對于整體差異的影響,進而影響結(jié)果(如準確和足夠多的找出生物標志物)。因此根據(jù)不同的生物類型,需要不同的生物學(xué)重復(fù)來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些?
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。代謝組學(xué)研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。河南脂質(zhì)代謝組學(xué)多主要技術(shù)
代謝組學(xué)效仿了基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。南京LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)檢測多少錢
藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別:代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物。這些代謝物是糖,脂肪,蛋白質(zhì),核酸,膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的,是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比,發(fā)現(xiàn)潛在標志物,指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好,相當(dāng)具有靶向性,因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體,和具體的藥效,藥代動的效應(yīng)。南京LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)檢測多少錢
上海拜譜生物科技有限公司位于東川路555號丙樓1171室。公司自成立以來,以質(zhì)量為發(fā)展,讓匠心彌散在每個細節(jié),公司旗下多組學(xué)服務(wù),質(zhì)譜檢測,蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué)深受客戶的喜愛。公司從事商務(wù)服務(wù)多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計、強大的技術(shù),還有一批獨立的專業(yè)化的隊伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造高品質(zhì)服務(wù)體驗,為客戶成功提供堅實有力的支持。