我國(guó)科學(xué)家已經(jīng)在重大疾病如肝病、維甲酸誘導(dǎo)白血病細(xì)胞凋亡啟動(dòng)模型及維甲酸定向誘導(dǎo)胚胎干細(xì)胞向神經(jīng)系統(tǒng)分化的模型等比較蛋白質(zhì)組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質(zhì)組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質(zhì)組學(xué)的重要應(yīng)用領(lǐng)域有：在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用、在植物研究中的應(yīng)用、在腎臟病學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。我們通過研究蛋白質(zhì)組，可以為患者提供有用的疾病診斷、診療、預(yù)后評(píng)估信息；可以早期更為準(zhǔn)確的診斷出胰腺病；也可以為AD的診斷、診療藥物的設(shè)計(jì)和篩選奠定基礎(chǔ)。這項(xiàng)研究技術(shù)其實(shí)離我們生活非常近，對(duì)我們生命而言尤為重要。近年來，高通量蛋白質(zhì)分離與鑒定技術(shù)，如雙向電泳、生物質(zhì)譜、蛋白質(zhì)芯片、酵母雙雜交系統(tǒng)、生物信息學(xué)等相繼建立并日趨完善，加速了蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展。蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。南京PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域
蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織、細(xì)胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對(duì)象，通過對(duì)蛋白組進(jìn)行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學(xué)功能、作用機(jī)制、疾病診斷的標(biāo)志物以及預(yù)測(cè)蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水平預(yù)測(cè)的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。常用技術(shù)：非靶向蛋白組學(xué)：蛋白質(zhì)定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學(xué)。南京修飾蛋白組學(xué)領(lǐng)域?qū)θ祟惗裕鞍踪|(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類的健康。
蛋白質(zhì)組學(xué)：常用技術(shù)：靶向蛋白組（PRM靶向蛋白/肽段定量），修飾蛋白組學(xué)（定量磷酸化修飾組學(xué)、定量糖基化修飾蛋白組學(xué)、定量乙酰化修飾蛋白組學(xué)和定量泛素化修飾蛋白組學(xué)），互作蛋白組學(xué)（代謝物與蛋白互作研究）。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)？大概可以測(cè)到多少的蛋白種類？原則上只要能提取到蛋白，就可以做蛋白組檢測(cè)。樣本測(cè)到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫(kù)和樣本本身蛋白濃度有關(guān)，一般數(shù)據(jù)庫(kù)越大，可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。也與樣本的類型有關(guān)，通常，組織細(xì)胞相比于體液樣本，能夠鑒定到更多的蛋白。
蛋白質(zhì)組學(xué)：質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)的基本原理主要是通過測(cè)定被測(cè)樣品離子的理化性質(zhì)來進(jìn)行分析，根據(jù)樣品的質(zhì)量譜圖和相關(guān)信息從而得到定性和定量結(jié)果。目前，蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時(shí)間（retentiontime）、質(zhì)荷比（m/z）、離子強(qiáng)度（intensity）這三個(gè)維度對(duì)肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量，即3D蛋白質(zhì)組學(xué)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度，離子淌度（mobility），主要根據(jù)離子的形狀和截面對(duì)離子進(jìn)行分離，能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段，使低豐度蛋白信號(hào)能夠被區(qū)分和識(shí)別出來。4D蛋白質(zhì)組學(xué)基于timsTOFPro質(zhì)譜儀，結(jié)合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation，同步累積連續(xù)碎裂）與TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，離子遷移譜），可重復(fù)測(cè)量所有檢測(cè)離子的碰撞截面（CCS），能更快、更靈敏的進(jìn)行蛋白質(zhì)組定性和定量。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段，當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展，我認(rèn)為今后我們會(huì)更多地在現(xiàn)實(shí)生活中見到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變（鐮刀形紅細(xì)胞癥）、糖化血紅蛋白比例測(cè)定等。從測(cè)試體量估計(jì)，應(yīng)該遠(yuǎn)小于1%的ELISA測(cè)試量。由于成本和通量等原因，蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并不如ELISA適合大量的日常分析。但對(duì)于一些分析有問題的項(xiàng)目，采用基于質(zhì)譜（或二維膠等手段）的蛋白質(zhì)組學(xué)有獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢(shì)。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)方法開發(fā)和驗(yàn)證周期短，在中高級(jí)特殊應(yīng)用（如極少使用的特殊蛋白指標(biāo)臨床檢測(cè)、未知疾病研究和控制）中也有其獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要。貴陽高通量蛋白質(zhì)組學(xué)報(bào)價(jià)
蛋白質(zhì)組的概念指由一個(gè)基因組，或一個(gè)細(xì)胞、組織表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。南京PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域
蛋白質(zhì)組學(xué)研究這樣做：蛋白質(zhì)組與基因組相對(duì)應(yīng)，也是一個(gè)整體的概念，隨著基因組學(xué)研究的不斷深入，蛋白質(zhì)組學(xué)已逐漸成為研究熱點(diǎn)，對(duì)蛋白組學(xué)的研究可以使我們更容易接近生命的機(jī)理本質(zhì)，但探究成千上萬的蛋白質(zhì)特性也是一個(gè)重大的技術(shù)挑戰(zhàn)。蛋白質(zhì)組（Proteome）指的是某一時(shí)刻或某一狀態(tài)基因組表達(dá)的所有相應(yīng)的蛋白，即細(xì)胞、組織或機(jī)體全部蛋白質(zhì)的存在及活動(dòng)形式，其是一個(gè)動(dòng)態(tài)概念，它是在組織、細(xì)胞的整體蛋白質(zhì)水平上，探索蛋白質(zhì)作用模式、功能機(jī)理、調(diào)節(jié)控制以及蛋白質(zhì)群體內(nèi)的相互關(guān)系、從而獲得生命活動(dòng)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的全方面而深入的認(rèn)識(shí)，以揭示生命活動(dòng)的基本規(guī)律。南京PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域
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