代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些？代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（分子量<1000）。其樣品主要是血漿或血清，尿液，唾液，以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位（如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等）合作，做過植物，微生物提取物，腦脊液，昆蟲血淋巴，羊水，卵泡液，膝蓋滑液，眼淚，胎盤，糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。一般代謝組學(xué)能檢測出多少物質(zhì)？同的質(zhì)譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣，而且不同平臺之間具有互補(bǔ)性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準(zhǔn)確定性的物質(zhì)約200個左右，檢測尿液樣品定性的物質(zhì)約200個左右，其他樣品（如肝臟，糞便，腸道內(nèi)容物）也在幾百這個數(shù)量級。如果采用全二維GC/MS，物質(zhì)的數(shù)量要更多，可達(dá)1千以上。LC/MS檢測物質(zhì)的數(shù)量要遠(yuǎn)比GC/MS多，但能準(zhǔn)確定性和定量的不多，視不同的平臺(TQ、QTOF等)能達(dá)到幾十至2-3百個物質(zhì)。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比， 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性。湖北脂質(zhì)代謝組學(xué)多費(fèi)用
代謝組學(xué)樣本收集指南：1.血漿樣本收集：（1）從合適的靜脈采集血液（典型10mL）到標(biāo)記的肝素鋰血漿收集管中（肝素鋰用作抗凝劑）。（2）立即于4 °C離心（3000g）20min，上清液即為血漿。（3）離心完畢，取出血漿收集管，取上清液（血漿），分等份（0.5mL或0.1mL），轉(zhuǎn)移到凍存管中（冰上），旋蓋。（4）保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集：（1）從合適的靜脈采集血液（典型10mL）到血清收集管中。（2）將血清收集管冰水?。?℃）凝集至少1h（2h以內(nèi)），記錄凝集時間。（3）將血清收集管放到冷凍離心機(jī)中低溫（4℃）離心15min（2500 g）。（4）離心完畢，取出血清收集管，取上清液，分等份（0.5mL或0.1mL），轉(zhuǎn)移到凍存管中（冰上），旋蓋。（5）保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。哈爾濱脂質(zhì)代謝組學(xué)多技術(shù)服務(wù)代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。
代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法：多變量分析：多變量分析方法能同時處理數(shù)百或數(shù)千個變量，并且能處理變量之間的相互關(guān)系。利用變量之間的協(xié)方差或相關(guān)性，使原始數(shù)據(jù)在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數(shù)據(jù)中的信息。但是如果存在大量無信息變量可能會妨礙多變量分析的能力，無信息變量的數(shù)量越多，減少真陽性數(shù)量的效果就越明顯。多變量分析分為無監(jiān)督分析方法和有監(jiān)督分析方法。在代謝組學(xué)分析中無監(jiān)督學(xué)習(xí)有主成分分析只需要數(shù)據(jù)集X，而有監(jiān)督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析，這類方法在分析時除了需要數(shù)據(jù)集X，還需對樣品進(jìn)行指定并分組, 這樣分組后模型將自動加上另外一個隱含的數(shù)據(jù)集Y，通常Y的賦值用-1/1或者0/1表示類別信息。
代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合，樣本采集需要注意什么？絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有：臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液；細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液；植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發(fā)生變化，我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態(tài)，因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的，采集后通過低溫淬滅（如液氮淬滅或低溫凍存等）的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外，不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法，具體步驟請參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。代謝組學(xué)的研究介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間。
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用： 代謝組學(xué)研究人員已經(jīng)對此進(jìn)行了研究。新生兒是否缺失酶基因，可以在出生時就檢測出來?？蓹z測出包括涉及合成途徑中的基本成分（如氨基酸）的酶。酶缺失的結(jié)果就是相應(yīng)的代謝產(chǎn)物過少或過多。尿癥（PKU）是一種常見的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯丙氨酸水解成酪氨酸所必須的苯丙氨酸水解酶基因，導(dǎo)致血液中苯丙氨酸累積造成的。若是不能及時檢測出這種天生的代謝缺乏，在嬰兒出生后九個月內(nèi)，就會引起無法挽救的大腦損傷。這種疾病通過簡單的血樣和尿素化驗就可以確診。而血樣和尿素化驗以后也將成為代謝指紋研究方法的一部分。像尿癥那樣的疾病，研究人員正試圖從疾病的生物化學(xué)基礎(chǔ)著手，而不是只有檢測生物標(biāo)記物。他們希望通過代謝組學(xué)，可以找到更好的方法去治這些疾病。代謝組學(xué) （metabolomics）的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。四川靶向代謝組學(xué)分析研究
代謝組學(xué)主要研究的是各種代謝路徑的底物。湖北脂質(zhì)代謝組學(xué)多費(fèi)用
代謝組學(xué)介紹：通過液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化，重點(diǎn)尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物，進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系，其研究對象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術(shù)優(yōu)勢：較高的靈敏度、分辨率；較寬的動態(tài)范圍；適合對標(biāo)本中未知代謝物的探索研究；適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標(biāo)志物的鑒定。代謝組學(xué)應(yīng)用方向： 土壤代謝組學(xué)。研究土壤中有機(jī)質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用，了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力，為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。湖北脂質(zhì)代謝組學(xué)多費(fèi)用
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