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廣東LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

來源: 發(fā)布時間:2022-01-07

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)?生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量(如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動的下游,收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大,生物學(xué)重復(fù)少可能會放大組內(nèi)差異對于整體差異的影響,進(jìn)而影響結(jié)果(如準(zhǔn)確和足夠多的找出生物標(biāo)志物)。因此根據(jù)不同的生物類型,需要不同的生物學(xué)重復(fù)來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個熱點(diǎn)領(lǐng)域。廣東LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

代謝組學(xué)樣本收集注意事項(xiàng):1.對于動物組織樣本無法滿足50mg/樣,如海馬組織,大腦組織等,可考慮同組混樣以達(dá)到50mg/樣的要求。2.對于含水量高的果實(shí)進(jìn)行取樣很難保持高度均一性(如番茄的果皮、果肉等),建議將整個果實(shí)進(jìn)行液氮研磨后凍干混勻,對混勻后的粉末進(jìn)行稱重分裝,凍存。3.盡量不要使用錫箔紙以及自封袋包裝樣本,建議將樣本液氮研磨后使用離心管/凍存管進(jìn)行分裝。4.在使用PBS緩沖液/超純水進(jìn)行漂洗時,需要盡快處理。5.植物各類組織樣本建議都使用超純水進(jìn)行漂洗完之后,再研磨分裝凍存,防止因種植過程中施加的一些肥料、農(nóng)藥等含有表面活性劑或其他雜質(zhì),對后續(xù)實(shí)驗(yàn)造成影響。濟(jì)南動物靶向代謝組學(xué)分析代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些?

代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?根據(jù)不同的檢測要求,需要配合不同的樣本量和樣本采集方法,常規(guī)的方法和單個樣本量如下:(1) 微生物和細(xì)胞樣本:細(xì)胞迅速猝滅細(xì)胞并冷凍保存;單個樣本細(xì)胞數(shù)量要求10^6。(2) 動物體液(如尿、血、組織、唾液):采樣后要迅速預(yù)處理,如加入抗凝血劑、防腐劑,并立即冷凍處理(-80 ℃);單個樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉(zhuǎn)入-80℃保存,單個樣本要求質(zhì)量為50mg。

代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標(biāo)分子。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS,因?yàn)榇x物大多數(shù)都不是高沸點(diǎn)的,而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點(diǎn)物質(zhì)難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學(xué)不是很多,一方面是NMR這個東西入行起點(diǎn)有點(diǎn)高,另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確(比如異構(gòu)體)因此對定性非常有用,成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。

代謝組學(xué)概念:代謝組學(xué)(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,對生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關(guān)系的研究方式,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。其研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。先進(jìn)分析檢測技術(shù)結(jié)合模式識別和**系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。 代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來的一門學(xué)科,是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分?;蚪M學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分別從基因和蛋白質(zhì)層面探尋生命的活動,而實(shí)際上細(xì)胞內(nèi)許多生命活動是發(fā)生在代謝物層面的,如細(xì)胞信號釋放(cell signaling),能量傳遞,細(xì)胞間通信等都是受代謝物調(diào)控的。代謝組學(xué)正是研究代謝組(metabolome)——在某一時刻細(xì)胞內(nèi)所有代謝物的組合——的一門學(xué)科。代謝組學(xué)可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。山東農(nóng)學(xué)靶向代謝組學(xué)定性分析

代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來的一門學(xué)科。廣東LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

代謝組學(xué)應(yīng)用方向:腸道菌群代謝組學(xué),運(yùn)用代謝組學(xué)檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關(guān)系,為疾病的預(yù)防,調(diào)高宿主的健康水平提供新的思路。經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué):對生物體、組織或細(xì)胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進(jìn)行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,揭示脂質(zhì)代謝與細(xì)胞乃至機(jī)體的生理、病理過程之間的關(guān)系,普遍運(yùn)用于分子生理學(xué)、功能基因組學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。廣東LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

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