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廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-12-26

轉(zhuǎn)錄組是特定發(fā)育階段或生理?xiàng)l件下細(xì)胞內(nèi)的完整轉(zhuǎn)錄信息的匯合,表示了基因表達(dá)的中間狀態(tài)。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以對(duì)所有轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行分類、確定基因的轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)、量化轉(zhuǎn)錄物的表達(dá)水平。蛋白質(zhì)是生命功能的直接執(zhí)行者,蛋白組是一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。整合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的表達(dá)數(shù)據(jù)對(duì)生物樣本進(jìn)行研究,可以從整體上解釋生物學(xué)問(wèn)題,探究生物體生理和疾病機(jī)理等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用于胃腸瘤發(fā)生機(jī)制研究:利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)可檢測(cè)瘤細(xì)胞惡化過(guò)程中的RNA(編碼RNA及非編碼RNA)的變化,有助于更好地理解胃腸瘤的發(fā)生機(jī)制。轉(zhuǎn)錄組學(xué)無(wú)需了解物種基因信息,能夠直接對(duì)任何物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析。廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì)有:1、可以直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準(zhǔn)確度;2、靈敏度高,可以檢測(cè)細(xì)胞中少至幾個(gè)拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;3、可以對(duì)任意物種進(jìn)行全基因組分析,能夠檢測(cè)未知基因,發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本,并準(zhǔn)確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)及cSNP,UTR區(qū)域;4、檢測(cè)范圍廣,能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)是需要生物學(xué)重復(fù)的,至少需要兩次生物學(xué)重復(fù),3次以上的生物學(xué)重復(fù)更好。以3個(gè)重復(fù)為例,加上對(duì)照的三個(gè)生物學(xué)重復(fù),一次RNA-seq需要6個(gè)樣本。湖北轉(zhuǎn)錄組學(xué)服務(wù)RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)即對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序和分析。

轉(zhuǎn)錄組及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq):轉(zhuǎn)錄組即特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)主要通過(guò)高通量測(cè)序研究特定組織或細(xì)胞在某個(gè)時(shí)期轉(zhuǎn)錄出來(lái)的mRNA的表達(dá)量,進(jìn)而對(duì)相關(guān)基因和表型的關(guān)系進(jìn)行分析。本質(zhì)上講RNA-seq就是在用一種新的方法實(shí)現(xiàn)“基因決定性狀”的經(jīng)典思路。在RNA-seq之前用于研究基因組表達(dá)分析的主要技術(shù)是基因芯片,不過(guò)由于高通量測(cè)序成本的下降,RNA-seq的運(yùn)用愈來(lái)愈普遍。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域:農(nóng)林領(lǐng)域:生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,抗逆脅迫機(jī)制,育種,物種保護(hù)研究等;畜牧業(yè):生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,致病機(jī)理研究,肉類及乳制品品質(zhì)研究等;海洋水產(chǎn):生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,漁業(yè)資源,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;微生物:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫(yī)藥:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,藥物開(kāi)發(fā),個(gè)性化醫(yī)治等;環(huán)境科學(xué):發(fā)酵過(guò)程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危害風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等;食品科學(xué):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開(kāi)發(fā),食品安全監(jiān)檢測(cè)等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序有什么樣的樣品要求?

轉(zhuǎn)錄組學(xué)和基因組學(xué)目前有實(shí)用價(jià)值嗎?二者實(shí)用價(jià)值非常大,尤其是對(duì)有瘤的患者的醫(yī)治,簡(jiǎn)直顛覆了傳統(tǒng)醫(yī)治的模式。轉(zhuǎn)錄組和基因組月在生物學(xué)研究中有著重要價(jià)值。例如研究某個(gè)基因功能的時(shí)候,可以構(gòu)建該基因的敲除或者過(guò)表達(dá)生物,然后對(duì)比野生型進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析看看該基因涉及什么表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。此外在醫(yī)學(xué)方面的應(yīng)用也很大,例如在有的瘤病人中進(jìn)行基因組學(xué)測(cè)序和分析能夠了解其中的發(fā)生的發(fā)展的驅(qū)動(dòng)基因,然后能根據(jù)發(fā)展的驅(qū)動(dòng)基因研究靶向藥物,從而推動(dòng)瘤的藥物研發(fā)和醫(yī)治!轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達(dá)水平的同時(shí),還能發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本。武漢單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)分析

轉(zhuǎn)錄組學(xué)有高通量、更精確的數(shù)字信號(hào)。廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)也稱為環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué),指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時(shí)期菌群群體全部基因轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律,以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應(yīng)機(jī)制,探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機(jī)理。其適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)以生態(tài)環(huán)境中的全部RNA為研究對(duì)象,避開(kāi)了微生物分離培養(yǎng)困難的問(wèn)題,能有效的擴(kuò)展微生物資源的利用空間。應(yīng)用領(lǐng)域:包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物。廣州高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用

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