蛋白質組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。研究的內容主要包括:組成蛋白質一級結構氨基酸的序列特征、蛋白質的豐度、蛋白質活性、蛋白質的修飾、亞細胞定位和三維結構、蛋白質之間的相互作用以及對蛋白質的高階復合物結構。質譜技術的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術支撐,使得許多有實際應用的蛋白質組功能研究成為可能,包括翻譯后修飾的整體分析,蛋白質相互作用網絡的重建和模式生物蛋白表達譜的定量研究;在臨床醫(yī)學和轉化醫(yī)學研究中也越來越多地應用到蛋白質組學技術。蛋白質組學研究的首要任務是建立獲取和分析蛋白質的常規(guī)、可靠、有效的技術。貴州常規(guī)蛋白質組學價格
蛋白質組學概念:蛋白質組學(英語:proteomics,又譯作蛋白質體學),是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質組(Proteome)一詞,源于蛋白質(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合,意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”,即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發(fā)生,細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。上海TMT/iTRAQ標記定量蛋白質組學價格蛋白質組的研究能為生命活動規(guī)律提供物質基礎。
定量蛋白質組學分析:特點:(1)不同樣本標記之后混樣,統(tǒng)一處理上機,減少了分別上機造成的實驗誤差,并利用同位素標簽的豐度來檢測,定量更準確,重復性更好;(2)由于需要標記試劑標記,因此成本相對較高;(3)通量高,在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品;(4)利用基于同一個參考樣品的辦法,可以進行多于8個樣品的定量比較;(5)iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質組學分析:Label-Free定量,即非標記的定量蛋白質組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。
我們究竟怎么研究蛋白質組學呢?目前高通量檢測蛋白質的方法中,還是首推基于質譜的方法,納流液相可以將復雜樣品中的肽段高效地分離,然后依次進入質譜,對每個被離子化的肽段及其碎裂后碎片的荷質比進行分析,從而得到該肽段的序列信息,然后根據對應的色譜峰面積或者報告離子強度等信息,我們又可以得到該肽段的定量信息。蛋白組學研究怎么做?當下蛋白組學研究中應用比較普遍的技術是同位素標記定量(iTRAQ/TMT技術)。iTRAQ/TMT技術是利用DDA掃描模式,其掃描的方式是將一級質譜信號比較強的Top20的多肽進行二級打碎,然后進入二級質譜進行檢測。其優(yōu)勢是二級譜圖采集的肽段信息都來源于同一條多肽,有利于后續(xù)的定性分析。生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術。
LabelFree(非標記蛋白質組學技術):在非標記策略的定量模型中,主要涉及兩種不同的算法:其一,以肽段的色譜峰積分面積為基礎,通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度;其二,以肽段被質譜檢測的計數為基礎,通過歸一化來表征被檢測蛋白質的相對豐度。非標記技術認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率(Counts)與其在混合物中的豐度成正相關,因此蛋白質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度,通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來,從而對蛋白質進行定量。定量蛋白質組學技術主要分為標記(label)和非標記(label free)定量策略。江蘇修飾蛋白組學質譜分析
蛋白質組(Proteome)一詞,源于蛋白質(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合。貴州常規(guī)蛋白質組學價格
蛋白質組學發(fā)展趨勢:1、基礎研究方面:近兩年來蛋白質組研究技術已被應用到各種生命科學領域,如細胞生物學、神經生物學等。在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍,涉及到各種重要的生物學現象,如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。在未來的發(fā)展中,蛋白質組學的研究領域將更加普遍。2、應用研究方面:蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質組技術也有十分誘人的前景,目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質組學方面的應用性研究。貴州常規(guī)蛋白質組學價格
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