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山東LC-MS/MS非靶向代謝組學技術服務

來源: 發(fā)布時間:2022-05-26

代謝組學研究方法: 對于代謝產(chǎn)物來說,不只只有質(zhì)譜峰這個特征。更進一步說,質(zhì)譜(MS)并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物,并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠,而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì),但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振(NMR)的方法,可以彌補色譜的不足。過去,只有毒理學方面的研究使用核磁共振,而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今,這兩種方法在代謝組學研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進行有意義的比較,研究人員必須結合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進行分析。此外,還需要結合基因組學研究獲得的數(shù)據(jù)。代謝產(chǎn)物是基因表達的產(chǎn)物,在代謝酶的作用下生成。山東LC-MS/MS非靶向代謝組學技術服務

代謝組學介紹:通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系,其研究對象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術優(yōu)勢:較高的靈敏度、分辨率;較寬的動態(tài)范圍;適合對標本中未知代謝物的探索研究;適合于生物樣本中復雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標志物的鑒定。代謝組學應用方向: 土壤代謝組學。研究土壤中有機質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。山東LC-MS/MS非靶向代謝組學技術服務代謝組學是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律。

LC-MS非靶向代謝組學:LCMS非靶向是通過液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動態(tài)變化,從中找出表達差異的代謝物,進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時采集代謝物的一二級質(zhì)譜信息,結合代謝組學數(shù)據(jù)處理軟件對質(zhì)譜信息的解析,在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。

非靶向代謝組學:新陳代謝網(wǎng)絡是復雜的網(wǎng)絡,特別是人體的代謝網(wǎng)絡,一直被認為是相對復雜的代謝網(wǎng)絡?,F(xiàn)在多數(shù)信號通路的研究是集中在代謝網(wǎng)絡的一個很小的領域?;蚪M學、蛋白組學研究已經(jīng)揭示了部分調(diào)節(jié)通路,但是和代謝網(wǎng)絡直接相關的是代謝產(chǎn)物。從多種代謝產(chǎn)物中選取研究對象,無疑是困難的。非靶向代謝組學又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學,主要是將對照組和實驗組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進行比對,以找出其代謝物的差異。代謝組學研究通過一定的手段能夠幫助研究員從代謝產(chǎn)物海中跳出來,提供一個“航拍”的視角,從而發(fā)現(xiàn)差異性代謝產(chǎn)物。然后通過已知的代謝通路逆推找出調(diào)節(jié)酶和基因,完成疾病發(fā)病機制、藥物療理機制等方面的研究。代謝組學有哪些特點?

選擇代謝組學作為科研技術手段的優(yōu)勢有哪些?1、代謝組學的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質(zhì)和細胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。2、小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達的下游產(chǎn)物,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。3、代謝物的種類少,大約在103個數(shù)量級,要遠小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結構要簡單得多,分析起來更簡單明了。4、代謝組學的代謝物信息庫簡單,它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫那么復雜。5、基因和蛋白質(zhì)表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易。6、代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學研究中采用的技術更容易在各個領域中通用,也更容易被人接受。代謝組學是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進行定性和定量分析的一門新學科。上海LC-MS/MS非靶向代謝組學研究

為什么選擇代謝組學作為科研技術手段?山東LC-MS/MS非靶向代謝組學技術服務

代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比,代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比,代謝組學與生理學的聯(lián)系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。山東LC-MS/MS非靶向代謝組學技術服務