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來源: 發(fā)布時間:2022-05-25

常用的定量蛋白質組學技術方法有以下幾類:非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術:Label free定量蛋白組學技術是通過液質聯(lián)用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產(chǎn)生的質譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應肽段的信號強度,從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。TMT定量蛋白組學技術:這種技術采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標簽,特異性標記多肽的氨基基團進行串聯(lián)質譜分析,能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量,可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質表達水平的差異。Label free定量蛋白組學技術無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準。哈爾濱定量乙?;鞍踪|組學價錢

iTRAQ/TMT標記定量蛋白質組介紹:iTRAQ/TMT標記定量蛋白質組研究是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質進行標記,利用標記試劑中的二級報告離子來對蛋白進行精確鑒定和定量。技術優(yōu)勢:1、適用范圍廣:可檢測到的蛋白除了胞漿蛋白外,還有線粒體蛋白、膜蛋白。也能對任何類型的蛋白質進行鑒定,包括高分子量,酸性,堿性蛋白質;2、高通量:一次可以實現(xiàn)多個樣品的定性定量分析,特別適用于采用多種處理方式或來自多個處理時間的樣本的差異蛋白分析。廣東常規(guī)蛋白質組學項目蛋白質組隨著基因組學研究的不斷深入,蛋白質組學已逐漸成為研究熱點。

蛋白質組學的分析介紹:蛋白質組學的分析主要指蛋白的生信分析,依賴于數(shù)據(jù)庫的建立?,F(xiàn)在常用的蛋白質組學生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO(gene ontology)是基因本體聯(lián)合會(Gene Onotology Consortium)所建立的數(shù)據(jù)庫。根據(jù)基因產(chǎn)物的相關分子功能、生物學途徑、細胞組分而給予定義,無物種相關性。是系統(tǒng)分析基因功能,它將基因組的信息與基因功能聯(lián)系起來,旨在揭示生命現(xiàn)象的遺傳與化學藍圖。旨在借助計算機全方面地展示細胞和生物所包含的生物學信息;根據(jù)基因組中的信息,用計算機計算或者預測出比較復雜的細胞中的通路或者生物的復雜行為。

蛋白質組學(英語:proteomics,又譯作蛋白質體學),是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質是生命存在和運動的物質基礎,是細胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動的執(zhí)行者,亦是基因功能活動的之后的執(zhí)行者,是生命現(xiàn)象復雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質組研究是為了識別及鑒定一個細胞或組織所表達的全部蛋白質以及它們的表達模式,是對基因組研究的重要補充,是對生物體在蛋白質水平上定量、動態(tài)、整體性的研究。這類研究有助于了解蛋白的結構、細胞的功能、生命的本質及活動規(guī)律,為疾病的診斷、疫苗及新藥開發(fā)提供科學依據(jù)。蛋白質組學由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發(fā)生,細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。

4D定量蛋白質組學 :目前,蛋白質組學質譜分析一般是根據(jù)保留時間(retention time)、質荷比(m/z)、離子強度(intensity)這三個維度對肽蛋白質進行鑒定和定量,即3D蛋白質組學。4D蛋白質組學在3D蛋白質組學的基礎之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進行分離,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。蛋白質組學分析策略:蛋白質組學分析包括分析蛋白質的結構和功能、翻譯后修飾情況、蛋白質定位、蛋白質表達情況以及蛋白質間的相互作用等等?;诓煌姆治鰞?nèi)容可以采用不同的蛋白質組學分析技術和分析策略。有很多蛋白質組學研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關研究和日常工作。濟南定量蛋白組學

質譜技術相較于傳統(tǒng)蛋白質鑒定技術而言,擁有靈敏、準確、高通量、自動化等特點。哈爾濱定量乙?;鞍踪|組學價錢

蛋白質學組翻譯后修飾的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法,分析組蛋白時其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時,通常需要將被檢測蛋白質消化成3-9kDa范圍內(nèi)的肽段,因此也無法保證檢測到的肽段的完整性。但是,由于儀器的進步和保留了組蛋白尾部的組合修飾,自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下:自上而下技術可以直接對完整的蛋白質進行測序,包括翻譯后修飾的蛋白質和其他大的蛋白質片段,而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關的信息,使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。哈爾濱定量乙酰化蛋白質組學價錢