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修飾蛋白組學(xué)研究

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-05-21

iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組介紹:iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行標(biāo)記,利用標(biāo)記試劑中的二級(jí)報(bào)告離子來(lái)對(duì)蛋白進(jìn)行精確鑒定和定量。技術(shù)優(yōu)勢(shì):1、適用范圍廣:可檢測(cè)到的蛋白除了胞漿蛋白外,還有線(xiàn)粒體蛋白、膜蛋白。也能對(duì)任何類(lèi)型的蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定,包括高分子量,酸性,堿性蛋白質(zhì);2、高通量:一次可以實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品的定性定量分析,特別適用于采用多種處理方式或來(lái)自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析。生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中比較重要的鑒定技術(shù)。修飾蛋白組學(xué)研究

蛋白質(zhì)組學(xué)介紹:蛋白質(zhì)組學(xué),指對(duì)某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對(duì)蛋白質(zhì)的高階復(fù)合物結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)組主要通過(guò)蛋白質(zhì)雙向電泳、氨基酸序列測(cè)定、質(zhì)譜、生物信息等方法,研究某個(gè)基因組對(duì)應(yīng)的所有蛋白質(zhì)特征,包括蛋白質(zhì)含量、亞細(xì)胞定位、活性以及蛋白修飾等內(nèi)容。北京Label free多肽組學(xué)分析方法蛋白質(zhì)組研究技術(shù)覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍。

蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域:1.蛋白質(zhì)鑒定:能夠應(yīng)用一維電泳和二維電泳并分離相關(guān)的技術(shù),應(yīng)用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及共沉淀等技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)停止審定研討。2.修飾:很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要閱歷后修飾如磷酸化,糖基化,酶原刺激等。修飾是蛋白質(zhì)調(diào)理功用的重要方式,因而對(duì)蛋白質(zhì)后修飾的研討對(duì)說(shuō)明蛋白質(zhì)的功用具有重要作用。3、蛋白質(zhì)功用:如剖析酶活性和酶底物,細(xì)胞因子的生物剖析/配基-受體分離剖析。能夠應(yīng)用基因敲除和反義技術(shù)剖析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功用。另外對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)出來(lái)后在細(xì)胞內(nèi)的定位研討也在水平上有助于蛋白質(zhì)功用的理解。

蛋白組究竟研究原因:首先,由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在,RNA的表達(dá)量與實(shí)際對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高,就簡(jiǎn)單地測(cè)試了酵母中mRNA和對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性,結(jié)果是,低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低,而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高,經(jīng)過(guò)平均后r值只為0.4。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。蛋白組究竟研究的是什么呢?第1,蛋白質(zhì)定性,或者說(shuō)大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當(dāng)中;第2,蛋白質(zhì)定量,也就是大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)的含量(包括一定含量與相對(duì)含量);第3,蛋白質(zhì)翻譯后修飾,這些修飾主要包括磷酸化,泛素化,糖基化,乙?;鹊?,也包括對(duì)這些翻譯后修飾的定量研究。蛋白質(zhì)組的研究能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ)。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景意義:從生命活動(dòng)的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學(xué)的主要手段。而這些研究往往離不開(kāi)對(duì)細(xì)胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類(lèi)和表達(dá)量的研究。對(duì)處不同時(shí)期、不同條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化的研究,識(shí)別功能模塊和路徑,監(jiān)控疾病的生物標(biāo)志物,這些研究都需要對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量。生物質(zhì)譜技術(shù)的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析提供了更可靠、動(dòng)態(tài)范圍更廣的研究手段。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)?濟(jì)南TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存。修飾蛋白組學(xué)研究

蛋白質(zhì)組學(xué)定義:蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics),指對(duì)某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對(duì)蛋白質(zhì)的高階復(fù)合物結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法主要有:蛋白質(zhì)雙向電泳、氨基酸序列測(cè)定(包括N端測(cè)序和C端測(cè)序)、質(zhì)譜、生物信息學(xué)。修飾蛋白組學(xué)研究