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浙江PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-05-21

蛋白質(zhì)組學(xué)的分析介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析,依賴于數(shù)據(jù)庫的建立。現(xiàn)在常用的蛋白質(zhì)組學(xué)生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO(gene ontology)是基因本體聯(lián)合會(Gene Onotology Consortium)所建立的數(shù)據(jù)庫。根據(jù)基因產(chǎn)物的相關(guān)分子功能、生物學(xué)途徑、細(xì)胞組分而給予定義,無物種相關(guān)性。是系統(tǒng)分析基因功能,它將基因組的信息與基因功能聯(lián)系起來,旨在揭示生命現(xiàn)象的遺傳與化學(xué)藍(lán)圖。旨在借助計(jì)算機(jī)全方面地展示細(xì)胞和生物所包含的生物學(xué)信息;根據(jù)基因組中的信息,用計(jì)算機(jī)計(jì)算或者預(yù)測出比較復(fù)雜的細(xì)胞中的通路或者生物的復(fù)雜行為。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。浙江PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)組學(xué)基礎(chǔ)研究方面:近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域,如細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等。在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍,涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡?。?yīng)用研究方面:蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景,目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。浙江蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)格蛋白質(zhì)組具有很高的細(xì)胞和組織特異性,不同的細(xì)胞組織表達(dá)不同的蛋白質(zhì)組。

蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的?研究對象涉及到生物體且生物體內(nèi)表達(dá)蛋白,理論上都可以應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應(yīng)用科學(xué)。主要使用的儀器為液質(zhì)聯(lián)用高分辨率質(zhì)譜儀。詳細(xì)來說,蛋白質(zhì)組學(xué)包含許多分支:非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)(定性研究生物體的蛋白組成),定量蛋白質(zhì)組學(xué)(對生物體蛋白表達(dá)含量進(jìn)行測定),修飾蛋白質(zhì)組學(xué)(對蛋白質(zhì)翻譯后修飾進(jìn)行檢測)及相互作用蛋白質(zhì)組研究(蛋白質(zhì)直接相互作用機(jī)制解析)等。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究,針對基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測與定量。因此更能反應(yīng)出生物體生理?xiàng)l件下的水平與狀態(tài)。

4D定量蛋白質(zhì)組學(xué) :目前,蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時(shí)間(retention time)、質(zhì)荷比(m/z)、離子強(qiáng)度(intensity)這三個(gè)維度對肽蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量,即3D蛋白質(zhì)組學(xué)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進(jìn)行分離,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。蛋白質(zhì)組學(xué)分析策略:蛋白質(zhì)組學(xué)分析包括分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能、翻譯后修飾情況、蛋白質(zhì)定位、蛋白質(zhì)表達(dá)情況以及蛋白質(zhì)間的相互作用等等?;诓煌姆治鰞?nèi)容可以采用不同的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)和分析策略。通過對正常個(gè)體及病理個(gè)體間的蛋白質(zhì)組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”。

蛋白質(zhì)組學(xué)我的介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)采用高通量和大規(guī)模的研究手段,從整體的角度分析細(xì)胞內(nèi)動(dòng)態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成份、表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動(dòng)規(guī)律,之后達(dá)到構(gòu)建出細(xì)胞的“功能圖”的目的。蛋白質(zhì)作為生命活動(dòng)的物質(zhì)承擔(dān)者、生理功能的執(zhí)行者和生命現(xiàn)象的直接體現(xiàn)者,研究蛋白質(zhì)對闡明生命體的變化機(jī)制具有重要作用。蛋白質(zhì)組研究不只可以實(shí)現(xiàn)與基因組的關(guān)聯(lián),揭示生命活動(dòng)的發(fā)生規(guī)律。同樣對人類重大疾病的發(fā)生與發(fā)展的病理機(jī)制研究也具有重要作用。生命體的生理、病理過程,藥物和環(huán)境因子的作用都依賴于蛋白質(zhì),并引起蛋白質(zhì)的變化。蛋白質(zhì)組學(xué)研究對提高我國生物醫(yī)學(xué)原始創(chuàng)新能力、重大疾病防診治能力和國民健康水平以及新藥研發(fā)能力、生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白與蛋白相互作用等。深圳PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù)。浙江PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)組學(xué)(英語:proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)),是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時(shí)代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運(yùn)動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ),是細(xì)胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動(dòng)的執(zhí)行者,亦是基因功能活動(dòng)的之后的執(zhí)行者,是生命現(xiàn)象復(fù)雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質(zhì)組研究是為了識別及鑒定一個(gè)細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式,是對基因組研究的重要補(bǔ)充,是對生物體在蛋白質(zhì)水平上定量、動(dòng)態(tài)、整體性的研究。這類研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動(dòng)規(guī)律,為疾病的診斷、疫苗及新藥開發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。浙江PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究