蛋白組究竟研究原因：首先，由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在，RNA的表達量與實際對應蛋白質(zhì)的含量相關性并不高，就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質(zhì)的定量相關性，結(jié)果是，低豐度蛋白與mRNA的相關性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關性則高，經(jīng)過平均后r值只為0.4。蛋白質(zhì)組學相關技術(shù)目前在一小部分]應用中具有獨特優(yōu)勢。蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質(zhì)定性，或者說大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當中；第2，蛋白質(zhì)定量，也就是大規(guī)模檢測某些蛋白質(zhì)的含量（包括一定含量與相對含量）；第3，蛋白質(zhì)翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙?；鹊?，也包括對這些翻譯后修飾的定量研究。蛋白質(zhì)組學現(xiàn)已被普遍應用于生命科學研究領域。濟南Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學分析方法
4D定量蛋白質(zhì)組學 ：目前，蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時間（retention time）、質(zhì)荷比（m/z）、離子強度（intensity）這三個維度對肽蛋白質(zhì)進行鑒定和定量，即3D蛋白質(zhì)組學。4D蛋白質(zhì)組學在3D蛋白質(zhì)組學的基礎之上增加了第四維度，離子淌度（mobility），主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進行分離，能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段，使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。蛋白質(zhì)組學分析策略：蛋白質(zhì)組學分析包括分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能、翻譯后修飾情況、蛋白質(zhì)定位、蛋白質(zhì)表達情況以及蛋白質(zhì)間的相互作用等等。基于不同的分析內(nèi)容可以采用不同的蛋白質(zhì)組學分析技術(shù)和分析策略。上海PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)蛋白質(zhì)組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。
LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術(shù))：在非標記策略的定量模型中，主要涉及兩種不同的算法：其一，以肽段的色譜峰積分面積為基礎，通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度；其二，以肽段被質(zhì)譜檢測的計數(shù)為基礎，通過歸一化來表征被檢測蛋白質(zhì)的相對豐度。非標記技術(shù)認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率（Counts）與其在混合物中的豐度成正相關，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來，從而對蛋白質(zhì)進行定量。
iTRAQ定量蛋白組學技術(shù)：iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)多肽體外標記定量技術(shù)。這種技術(shù)同TMT定量蛋白組學技術(shù)相似，可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達水平的差異。Label-free：Label-free定量，即非標記的定量蛋白質(zhì)組學，不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。蛋白質(zhì)組學研究是生命科學進入后基因時代的特征。
蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容有什么？對人類而言，蛋白質(zhì)組學的研究要服務于人類的健康，主要指促進分子醫(yī)學的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。很多藥物本身就是蛋白質(zhì)，而很多藥物的靶分子也是蛋白質(zhì)。藥物也可以干預蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。在基礎醫(yī)學和疾病機理研究中，了解人不同發(fā)育、生長期和不同生理、病理條件下及不同細胞類型的基因表達的特點具有特別重要的意義。這些研究可能找到直接與特定生理或病理狀態(tài)相關的分子，進一步為設計作用于特定靶分子的藥物奠定基礎。蛋白質(zhì)組學技術(shù)有等電聚焦。貴州定量乙?；鞍踪|(zhì)組學檢測價格
通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”。濟南Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學分析方法
蛋白組學常見研究模式主要有兩種：1.通過蛋白質(zhì)組學尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標志物；2.結(jié)合其它組學建立疾病或者研究主題的表達譜和分子機制。蛋白質(zhì)組學( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)，包括組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序列，蛋白質(zhì)的豐度，蛋白質(zhì)的修飾以及蛋白質(zhì)之間的相互作用。蛋白質(zhì)組和基因組( genome)在概念上有相關性，表示某一個蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由基因組所編碼的，然而蛋白質(zhì)組學和基因組學在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別。濟南Label free非標記定量蛋白質(zhì)組學分析方法