蛋白質組學:質譜分析蛋白質組學的基本原理主要是通過測定被測樣品離子的理化性質來進行分析,根據樣品的質量譜圖和相關信息從而得到定性和定量結果。目前,蛋白質組學質譜分析一般是根據保留時間(retentiontime)、質荷比(m/z)、離子強度(intensity)這三個維度對肽蛋白質進行鑒定和定量,即3D蛋白質組學。4D蛋白質組學在3D蛋白質組學的基礎之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據離子的形狀和截面對離子進行分離,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。4D蛋白質組學基于timsTOFPro質譜儀,結合PASEF(ParallelAccumulationSerialFragmentation,同步累積連續(xù)碎裂)與TIMS(TrappedIonMobilitySpectrometry,離子遷移譜),可重復測量所有檢測離子的碰撞截面(CCS),能更快、更靈敏的進行蛋白質組定性和定量。定量蛋白質組學技術主要分為標記(label)和非標記(label free)定量策略。濟南外泌體蛋白質組學應用
蛋白質組學基礎研究方面:近兩年來蛋白質組研究技術已被應用到各種生命科學領域,如細胞生物學、神經生物學等。在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍,涉及到各種重要的生物學現象,如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。在未來的發(fā)展中,蛋白質組學的研究領域將更加普遍。應用研究方面:蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質組技術也有十分誘人的前景,目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質組學方面的應用性研究。外泌體蛋白質組學研究內容蛋白質組的復雜性也遠遠高于基因組,這是因為一個基因≠一個轉錄產物≠一個蛋白質。
定量蛋白質組學方法學介紹:Label-free:Label-free定量,即非標記的定量蛋白質組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free定量不需要標記處理,操作簡單,可以做任意樣本的總蛋白質差異定量,但對實驗操作的穩(wěn)定性、重復性要求較高,準確性也較標記定量差。因此,Label-free技術適合于大樣本量的定量比較,以及對無法用標記定量實現的實驗設計。
蛋白質組學在醫(yī)學的研究應用:蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。labelfree-非標定量法分析技術方法:非標定量法[Labelfree]是近年來重要的質譜定量方法,通過比較質譜分析次數或質譜峰強度,分析不同來源樣品蛋白的數量變化。蛋白質非標記定量技術(LabelFree)是通過液質聯(lián)用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產生的質譜數據,比較不同樣品中相應肽段的信號強度,從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。蛋白質組的研究能為生命活動規(guī)律提供物質基礎。
蛋白質組學應用領域:1.蛋白質鑒定:能夠應用一維電泳和二維電泳并分離相關的技術,應用蛋白質芯片和抗體芯片及共沉淀等技術對蛋白質停止審定研討。2.修飾:很多mRNA表達產生的蛋白質要閱歷后修飾如磷酸化,糖基化,酶原刺激等。修飾是蛋白質調理功用的重要方式,因而對蛋白質后修飾的研討對說明蛋白質的功用具有重要作用。3、蛋白質功用:如剖析酶活性和酶底物,細胞因子的生物剖析/配基-受體分離剖析。能夠應用基因敲除和反義技術剖析基因表達產物-蛋白質的功用。另外對蛋白質表達出來后在細胞內的定位研討也在水平上有助于蛋白質功用的理解。近兩年來蛋白質組研究技術已被應用到各種生命科學領域。濟南外泌體蛋白質組學應用
定量蛋白質組學通過對蛋白質的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。濟南外泌體蛋白質組學應用
蛋白質組學技術:等電聚焦:等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質分離等電點不同的蛋白質的電泳技術。等電聚焦凝膠電泳依據蛋白質分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質分子在含有載體兩性電解質形成的一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當蛋白質遷移至其等電點位置時,其靜電荷數為零,在電場中不再移動,據此將蛋白質分離。濟南外泌體蛋白質組學應用