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廣東代謝組學(xué)分析方法

來源: 發(fā)布時間:2022-04-18

代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。在食品安全領(lǐng)域,利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個熱點領(lǐng)域。廣東代謝組學(xué)分析方法

非靶向代謝組學(xué):非靶向代謝組學(xué)可用于檢測生物體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,通過數(shù)據(jù)處理,多維統(tǒng)計和數(shù)學(xué)建模來分析生物擾動下的代謝指紋圖譜。尋找兩組間發(fā)生明顯變化的差異代謝物,富集差異代謝通路, 獲得整個生物體的代謝輪廓。 技術(shù)優(yōu)勢: 1、代謝組學(xué)能放大基因組和蛋白組的微小變化,具有較高的靈敏度、分辨率; 2、具有較寬的動態(tài)檢測范圍;3、相比于基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué),檢測費用更為低廉;4、代謝組學(xué)比較貼近生物體表型,能更直接、準確地反映生物體的生理病理狀態(tài),適合于生物樣本中潛在標(biāo)志物的篩選,疾病分期等。濟南GC-MS非靶向代謝組學(xué)分析代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是色譜(HPLC,GC)。

什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)?(1) 非靶向代謝組學(xué)(Untargeted metabolomics)即非目標(biāo)代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時進行檢測分析的代謝組學(xué)。(2) 靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué),著重對于設(shè)定好的目標(biāo)代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢?系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢,主要體現(xiàn)在以下幾點:(1) 基因與蛋白質(zhì)表達的微小變化會在相應(yīng)代謝物水平上得到放大,更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。

代謝組學(xué):代謝組學(xué) (metabolomics)的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進行定性和定量分析的一門新學(xué)科。代謝組作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。 代謝產(chǎn)物是基因表達的產(chǎn)物,在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質(zhì)相比,代謝產(chǎn)物較小,但是不能形成代謝產(chǎn)物的細胞是死細胞,因此不能小看代謝產(chǎn)物的重要性。 研究人員通過對機體代謝產(chǎn)物的深入研究,可以判斷機體是否處于正常狀態(tài),而對基因和蛋白質(zhì)的研究都無法得出這樣的結(jié)論。事實上,代謝組學(xué)研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類疾病,如糖尿病、肥胖癥,代謝綜合癥。目前,已經(jīng)研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(huán)(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎癥途徑。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。

代謝組學(xué)如何控制臨床樣本的質(zhì)量?對于臨床的樣本建議每組比較低的25個生物學(xué)重復(fù),達到30例以上比較好。因為臨床樣本受外界環(huán)境和遺傳背景影響較大,需要很多生物學(xué)重復(fù)來消除這些外在影響。此外,在樣本收集過程中,應(yīng)保持收養(yǎng)的時間段和操作程序盡可能一致。代謝組學(xué)樣本收集取樣基本原則:表示性和一致性:驗組與對照組樣本在取材部位、時間處理等方面盡可能保持一致,從而保證實驗的可信度;迅速性:操作過程迅速,很大限度縮短樣本采集到實驗的時間;低溫原則:所有樣本離體后,分離步驟應(yīng)在4℃或冰上進行,分離好的樣本立即存于-80℃,以免樣本產(chǎn)生進一步代謝活動。代謝組學(xué) (metabolomics)的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。貴州代謝組學(xué)研究

代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些?廣東代謝組學(xué)分析方法

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用: 代謝組學(xué)研究人員已經(jīng)對此進行了研究。新生兒是否缺失酶基因,可以在出生時就檢測出來。可檢測出包括涉及合成途徑中的基本成分(如氨基酸)的酶。酶缺失的結(jié)果就是相應(yīng)的代謝產(chǎn)物過少或過多。尿癥(PKU)是一種常見的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯丙氨酸水解成酪氨酸所必須的苯丙氨酸水解酶基因,導(dǎo)致血液中苯丙氨酸累積造成的。若是不能及時檢測出這種天生的代謝缺乏,在嬰兒出生后九個月內(nèi),就會引起無法挽救的大腦損傷。這種疾病通過簡單的血樣和尿素化驗就可以確診。而血樣和尿素化驗以后也將成為代謝指紋研究方法的一部分。像尿癥那樣的疾病,研究人員正試圖從疾病的生物化學(xué)基礎(chǔ)著手,而不是只有檢測生物標(biāo)記物。他們希望通過代謝組學(xué),可以找到更好的方法去治這些疾病。廣東代謝組學(xué)分析方法