代謝組學(xué)究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學(xué)。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應(yīng)答規(guī)律。那么為什么代謝組學(xué)是基因組,轉(zhuǎn)錄組,蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代謝過程。基因測序數(shù)量太大,而且基因水平解釋問題往往很吃力。因?yàn)榛虻恼{(diào)控和生物學(xué)事件之間隔了一個很漫長的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。蛋白同理,一是蛋白種類巨大,二是蛋白組學(xué)發(fā)展進(jìn)入瓶頸;發(fā)展代謝組是因?yàn)榇x物種類只有不到1w種,建立它的差異分析更加簡單,同時在價格等方面更有推廣的意義。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。山東LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
代謝組學(xué)適用范圍:1、體液:血清、血漿、尿液、唾液、膝蓋滑液、腦脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、膽汁等。2、組織:各種動物組織和植物組織。3、細(xì)胞:細(xì)胞及細(xì)胞培養(yǎng)液等。3、微生物:大腸桿菌、鏈球菌等。4、其他:糞便、食糜、腸道內(nèi)容物等。應(yīng)用領(lǐng)域:1、非靶向代謝物組學(xué)結(jié)果的驗(yàn)證。2、代謝相關(guān)生理、病理研究。3、發(fā)酵工藝研究。4、食品科學(xué)與營養(yǎng)學(xué)研究。非靶向代謝組學(xué)分析內(nèi)容:非靶向代謝組學(xué)分析內(nèi)容大致包括數(shù)據(jù)的預(yù)處理(包括質(zhì)譜峰提取和質(zhì)譜峰校正)-數(shù)據(jù)質(zhì)控(包括t-檢驗(yàn)、主成分分析等)--差異代謝物分析(包括聚類分析、通路注釋分析、多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析等)。脂質(zhì)代謝組學(xué)多質(zhì)譜鑒定代謝組學(xué)是在基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來的一門學(xué)科。
為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?1)小分子的產(chǎn)生和代謝是生物機(jī)體作用的結(jié)果,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。2)基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易;3)代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單,但它遠(yuǎn)沒有全基因組測序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜;4)代謝物的種類少,要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多。5)代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。
什么是代謝組學(xué)?代謝組學(xué)是用來解決什么問題的?代謝組學(xué)(Metabonomics/Metabolomics)是發(fā)展起來的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似。
LC-MS非靶向代謝組的優(yōu)勢有什么?1、定性分析結(jié)果可靠,可以同時給出每一個組分的分子量和豐富的結(jié)構(gòu)信息;2、檢測限低,MS具備高靈敏度,通過選擇離子檢測(SIM)方式,其檢測能力還可以提高一個數(shù)量級以上;3、分析時間快,HPLC-MS使用的液相色譜柱為窄徑柱,縮短了分析時間,提高了分離效果;4、自動化程度高,HPLC-MS具有高度的自動化。關(guān)于質(zhì)譜,根據(jù)質(zhì)譜的工作原理,質(zhì)譜又分成了雙聚焦質(zhì)譜儀,四極桿質(zhì)譜儀,飛行時間質(zhì)譜儀,離子阱質(zhì)譜儀,傅立葉變換質(zhì)譜儀等不同種類。而在實(shí)驗(yàn)時,我們可以根據(jù)不同需要適當(dāng)調(diào)整儀器組和以及儀器附件。較低的費(fèi)用,是促使代謝組學(xué)在臨床上易于接受的另一個原因。四川非靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析
為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?山東LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定
代謝組學(xué)有哪些研究方式?根據(jù)有沒有研究目標(biāo)或方向來確定,在不確定代謝物或者代謝途徑時可使用非靶向代謝組學(xué)尋找切入點(diǎn),在有目標(biāo)時則使用靶向定量進(jìn)行深入研究,針對性研究脂質(zhì)的則可以使用脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)。另外比較新的,譜領(lǐng)生物還提供基于穩(wěn)定性同位素示蹤技術(shù)的代謝流組學(xué)技術(shù)服務(wù)來研究代謝流量問題。什么是代謝組學(xué)?代謝組學(xué)是末期發(fā)展起來的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。山東LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定