蛋白質(zhì)組學是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運動的物質(zhì)基礎,是細胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動的執(zhí)行者,亦是基因功能活動的執(zhí)行者,是生命現(xiàn)象復雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質(zhì)組研究是為了識別及鑒定一個細胞或組織所表達的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達模式,是對基因組研究的重要補充,是對生物體在蛋白質(zhì)水平上定量、動態(tài)、整體性的研究。這類研究有助于了解蛋白的結構、細胞的功能、生命的本質(zhì)及活動規(guī)律,為疾病的診斷、診療、疫苗及新藥開發(fā)提供科學依據(jù)。蛋白質(zhì)組學技術有飛行時間質(zhì)譜。濟南Label free多肽組學研究內(nèi)容
蛋白質(zhì)組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡。研究的內(nèi)容主要包括:組成蛋白質(zhì)一級結構氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細胞定位和三維結構、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對蛋白質(zhì)的高階復合物結構。質(zhì)譜技術的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術支撐,使得許多有實際應用的蛋白質(zhì)組功能研究成為可能,包括翻譯后修飾的整體分析,蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡的重建和模式生物蛋白表達譜的定量研究;在臨床醫(yī)學和轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究中也越來越多地應用到蛋白質(zhì)組學技術。河南高通量蛋白質(zhì)組學檢測多少錢蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征。
蛋白組學技術:蛋白質(zhì)組學研究的首要任務是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠、有效的技術。為達到這一要求,就需要樣品準備、數(shù)據(jù)獲取標準化及自動化,也就是要有可重復的高通量的技術。蛋白質(zhì)組學技術手段在不斷完善,其工作流程,包括蛋白質(zhì)樣本的制備、分離、定量及鑒定。由雙向凝膠電泳、質(zhì)譜技術、酵母雙雜交系統(tǒng)、蛋白質(zhì)微陣列技術、能進行大規(guī)模數(shù)據(jù)處理的計算機系統(tǒng)和軟件、軟電離技術及生物信息學技術構成了蛋白質(zhì)組學研究的主要技術體系。其中蛋白質(zhì)組學技術中的質(zhì)譜技術是現(xiàn)在比較常用的一種蛋白質(zhì)鑒定技術。
蛋白質(zhì)組學主要以全蛋白組(組織、細胞)、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象,通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析,揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預測蛋白的上、下游變化關系。蛋白質(zhì)組學可以克服核酸水平預測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。常用技術:非靶向蛋白組學:蛋白質(zhì)定性(膠條鑒定和溶液鑒定),高通量定量蛋白組(Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量),多肽組學。蛋白質(zhì)組學包括翻譯后的修飾。
常規(guī)蛋白質(zhì)組學:Labelfree多肽組學:顧名思義,就是不使用任何標記方法,直接對肽段進行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單,只需要對蛋白進行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機。定量方式分為兩種:峰面積(Peakintensity)和峰計數(shù)(Spectralcount),常用的是峰面積。不過,由于質(zhì)譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測,所以會丟失一些豐度較低的肽段信息,缺失值比較多。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學:TMT全稱是TandemMassTag,是經(jīng)典化學標記試劑,普遍用于差異表達蛋白質(zhì)組分析研究中。該技術采用6重、10重或16重同位素標簽,與肽段的氨基發(fā)生共價結合反應,可實現(xiàn)同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。(目前16標鹿明生物可提供技術服務)。蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合。濟南Label free多肽組學研究內(nèi)容
蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。濟南Label free多肽組學研究內(nèi)容
定量蛋白質(zhì)組學方法學介紹:Label-free:Label-free定量,即非標記的定量蛋白質(zhì)組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標記處理,操作簡單,可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量,但對實驗操作的穩(wěn)定性、重復性要求較高,準確性也較標記定量差。因此,Label-free技術適合于大樣本量的定量比較,以及對無法用標記定量實現(xiàn)的實驗設計。濟南Label free多肽組學研究內(nèi)容
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