蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢：1、基礎(chǔ)研究方面：近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域，如細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等。在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍，涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡椤?、應(yīng)用研究方面：蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景，目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。蛋白質(zhì)組學(xué)包括蛋白與蛋白相互作用等。湖北常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

蛋白質(zhì)組學(xué)概念：蛋白質(zhì)組學(xué)（英語：proteomics，又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)），是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組（Proteome）一詞，源于蛋白質(zhì)（protein）與基因組（genome）兩個詞的組合，意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”，即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征，包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生，細(xì)胞代謝等過程的整體而全方面的認(rèn)識。河南蛋白質(zhì)定量組學(xué)主要技術(shù)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有電噴霧質(zhì)譜。

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段，當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展，我認(rèn)為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變（鐮刀形紅細(xì)胞癥）、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計，應(yīng)該遠(yuǎn)小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因，蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目，采用基于質(zhì)譜（或二維膠等手段）的蛋白質(zhì)組學(xué)有獨特的技術(shù)優(yōu)勢。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)方法開發(fā)和驗證周期短，在中高級特殊應(yīng)用（如極少使用的特殊蛋白指標(biāo)臨床檢測、未知疾病研究和控制）中也有其獨特優(yōu)勢。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：特點：（1）不同樣本標(biāo)記之后混樣，統(tǒng)一處理上機(jī)，減少了分別上機(jī)造成的實驗誤差，并利用同位素標(biāo)簽的豐度來檢測，定量更準(zhǔn)確，重復(fù)性更好；（2）由于需要標(biāo)記試劑標(biāo)記，因此成本相對較高；（3）通量高，在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品；（4）利用基于同一個參考樣品的辦法，可以進(jìn)行多于8個樣品的定量比較；（5）iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析：Label-Free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。定量蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容。

常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)：Labelfree多肽組學(xué)：顧名思義，就是不使用任何標(biāo)記方法，直接對肽段進(jìn)行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單，只需要對蛋白進(jìn)行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機(jī)。定量方式分為兩種：峰面積（Peakintensity）和峰計數(shù)（Spectralcount），常用的是峰面積。不過，由于質(zhì)譜采集時只選取topN的母離子進(jìn)行二級碎裂和MS2檢測，所以會丟失一些豐度較低的肽段信息，缺失值比較多。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)：TMT全稱是TandemMassTag，是經(jīng)典化學(xué)標(biāo)記試劑，普遍用于差異表達(dá)蛋白質(zhì)組分析研究中。該技術(shù)采用6重、10重或16重同位素標(biāo)簽，與肽段的氨基發(fā)生共價結(jié)合反應(yīng)，可實現(xiàn)同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。（目前16標(biāo)鹿明生物可提供技術(shù)服務(wù)）。蛋白質(zhì)組的概念指由一個基因組，或一個細(xì)胞、組織表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。河南蛋白質(zhì)定量組學(xué)主要技術(shù)

蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征。湖北常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

蛋白組學(xué)研究怎么做？PRM:平行反應(yīng)監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù)，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進(jìn)行選擇性檢測，從而實現(xiàn)對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行一定定量，因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技術(shù)基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子，隨后在Collisioncell中對母離子進(jìn)行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進(jìn)行準(zhǔn)確地特異性分析。湖北常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析

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