蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略：自中而下：自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一種替代方法，分析組蛋白時(shí)其原理類似于自下而上分析策略。在使用這種分析方法時(shí)，通常需要將被檢測(cè)蛋白質(zhì)消化成3-9kDa范圍內(nèi)的肽段，因此也無(wú)法保證檢測(cè)到的肽段的完整性。但是，由于儀器的進(jìn)步和保留了組蛋白尾部的組合修飾，自中而下分析法正逐漸受到歡迎。自中而下更接近于自下而上法的靈敏度。自上而下：自上而下技術(shù)可以直接對(duì)完整的蛋白質(zhì)進(jìn)行測(cè)序，包括翻譯后修飾的蛋白質(zhì)和其他大的蛋白質(zhì)片段，而不只是肽段。這可以比較大程度地保留與PTMs相關(guān)的信息，使其適用于組蛋白的全方面表征和分析。自上而下技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)的有效分辨率已達(dá)到229kDa，一次可以檢測(cè)到的蛋白質(zhì)數(shù)量也在增加。蛋白質(zhì)翻譯后修飾可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)。武漢蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的研究策略：目前，有幾種分析蛋白質(zhì)翻譯后修飾的策略，包括質(zhì)譜（MS）、Eastern blotting、放射性標(biāo)記和Western blotting。放射性標(biāo)記和Western blotting是比較傳統(tǒng)、特異性和相對(duì)定量的方法。該過(guò)程需要事先知道翻譯后修飾類型。局限性包括抗體的特異性和可用性。質(zhì)譜技術(shù)也常被用于翻譯后修飾分析，不受修飾類型和相關(guān)修飾位點(diǎn)的現(xiàn)有知識(shí)的限制。自下而上：自下而上的技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中使用的質(zhì)譜策略之一。在根據(jù)序列鑒定肽之前，需要使用蛋白酶消化蛋白質(zhì)。由于該技術(shù)不能保證在檢測(cè)過(guò)程中被檢測(cè)肽的完整性和穩(wěn)定性，因此無(wú)法獲得不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾之間關(guān)系的信息，這意味著它無(wú)法檢測(cè)到某些修飾。因此，該方法不適用于分析組蛋白的組合翻譯后修飾。武漢蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)蛋白質(zhì)有哪些翻譯后修飾？

蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型：根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同，可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類，即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、?；姿猁}蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過(guò)羥氨基酸（如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過(guò)精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 ?；姿猁}蛋白質(zhì)通過(guò)天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過(guò)半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法：免疫印跡技術(shù)是在凝膠電泳和固相免疫測(cè)定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的、根據(jù)特定抗原-抗體的特異性反應(yīng)來(lái)檢測(cè)復(fù)雜樣品中的某種蛋白質(zhì)的免疫生化分析方法。

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)定量分析：1. SILAC細(xì)胞標(biāo)記，組織/細(xì)胞破碎，提取、提純目的蛋白質(zhì)（基于SILAC的乙?；揎椊M學(xué)定量）。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對(duì)多肽片段進(jìn)行iTRAQ標(biāo)記（基于iTRAQ的乙?；揎椊M學(xué)定量）。4. 使用高效特異性乙酰化抗體對(duì)乙?；揎楇亩芜M(jìn)行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS對(duì)富集的乙酰化肽段進(jìn)行序列分析。6. 數(shù)據(jù)分析，比對(duì)不同樣本中蛋白乙?；揎椝讲町?，并對(duì)產(chǎn)生變化的生物學(xué)意義進(jìn)行解釋。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問(wèn)題？

蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)分析：基于LC-MS/MS分析能夠精確測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性，從而檢測(cè)蛋白質(zhì)或者多肽上位點(diǎn)發(fā)生何種修飾?？蓹z測(cè)修飾類型如下： 磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙?；?、丁?；?、丙二酰化、戊二?；?、琥珀?；渭谆?、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化：信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)理等；2、糖基化：蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等；3、乙?；夯虮磉_(dá)調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等；4、泛素化：細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等；5、甲基化：染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等；6、丙?；?/ 丙二?；?/ 戊二酰化 / 琥珀?；褐饕嬖谟诰€粒體和細(xì)菌中，與代謝過(guò)程密切相關(guān)。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有全方面性。南京蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)分析方法

乙酰化修飾對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。武漢蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)

乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析：乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析是指從蛋白質(zhì)組學(xué)的水平分析蛋白質(zhì)乙?；揎?，包括乙?；鞍踪|(zhì)的鑒定和定量。提供基于質(zhì)譜的乙酰化蛋白組研究服務(wù)。蛋白質(zhì)乙?；ńM蛋白乙?；头墙M蛋白乙?；?。組蛋白乙?；饕琴嚢彼嵋阴；言诨蜣D(zhuǎn)錄調(diào)控作用方面被普遍的研究。非組蛋白乙?；瘶?gòu)成了哺乳動(dòng)物細(xì)胞中乙?；鞍椎闹饕糠郑瑓⑴c了所有主要生物過(guò)程，包括蛋白質(zhì)的定位、轉(zhuǎn)移、功能和降解，遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制等。除了重要的生物學(xué)功能以外，乙?；鞍踪|(zhì)及其調(diào)控酶還與衰老和多種疾病（如神經(jīng)變形紊亂、心血管疾病等）緊密相關(guān)。因此，對(duì)乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組進(jìn)行研究有助于進(jìn)一步探索細(xì)胞的生命活動(dòng)與了解相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)制。武漢蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)

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