ITS1 或 ITS2 究竟哪

個片段能更好地反映群落組成仍存有爭議。

ITS1 通常比 ITS2 短，對物種分辨率低一些，但是

擴增和測序錯誤也低一些；ITS2 分辨率高，但是測

序的誤差會增加 OTU 的數(shù)量。研究表明，在不同

的生態(tài)環(huán)境和群落復(fù)雜性下，ITS1 和 ITS2 測序結(jié)

果反映的群落組成既存在一致性，也存在差異性。

例如，在部分土壤和外生菌根群落研究中，

ITS1 和 ITS2 呈現(xiàn)出了相似的結(jié)果；而在部分土壤

和人類腸道群落研究，ITS1 和 ITS2 的結(jié)果則

存在差異。我們的結(jié)果表明，針對 ITS2 片段的

擴增引物覆蓋度均高于針對 ITS1 片段的擴增引物。

總之，這些結(jié)果表明，群落結(jié)構(gòu)研究所關(guān)注的

標(biāo)記基因片段和引物選擇尚未標(biāo)準(zhǔn)化。 上海融享生物科技有限公司專業(yè)致力于16s 測序。江西環(huán)境微生物16S測序機構(gòu)哪家好

傳統(tǒng)的微生物鑒定方法，主要通過將微生物培養(yǎng)后依據(jù)形態(tài)學(xué)、生理生化反應(yīng)、生態(tài)學(xué)特征等進(jìn)行鑒別。 Orji 等指出這種方法只能檢測出約 1%的重要病原菌，而利用宏基因組學(xué)、高通量測序、系統(tǒng)發(fā)育樹分析等

技術(shù)，自然界中 的致病菌都能得到研究。隨著基因測序技術(shù)的發(fā)展，16S rDNA 擴增子測序技術(shù)的應(yīng)用

越來越，已成為研究大氣、水、油井等環(huán)境樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的重要手段。采用高通量測序技術(shù)對樣本 １６Ｓ ｒＤＮＡ 片段進(jìn)行測序，可以獲得準(zhǔn)確的序列信息和更大的數(shù)據(jù)量，從而 在后續(xù)分析中獲得更加深入、和可靠的結(jié)果。 江西環(huán)境微生物16S測序機構(gòu)哪家好對于不同的需求我們選擇不同的16s 18S ITS 測序。

用下一代測序技術(shù)(next generation sequencing，NGS)測定

16S/18S/ITS 某個可變區(qū)的序列，可以反映環(huán)境樣

品在細(xì)菌、、古菌等組成的微生物群落之間的

差異，對研究海洋、土壤、宿主等不同環(huán)境中的

微生物群落組成及動態(tài)變化有重要的指導(dǎo)作用，同

時也是系統(tǒng)發(fā)育和分類學(xué)研究中一種使用的方法。

顯，能夠反映出種屬間甚至菌株間的差異。此外，

ITS 序列片段較小(ITS1 和 ITS2 長度分別為 350 bp

和 400 bp 左右，但不同物種之間存在一定差異)，

易于分析。也就是說，ITS 具有更高的擴增和測序

成功率以及分類學(xué)分辨率，目前已被應(yīng)用于真

菌不同種屬的系統(tǒng)發(fā)育分析。

１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因間區(qū)不但可以用于菌種間的鑒別，還 可

以用來分辨１６ＳｒＲＮＡ 基因不能鑒別的非常接近的菌種和種

內(nèi) 菌 株，是 １６ＳｒＲＮＡ 基因分析很好的補充。金 中 淦

等利用１６ＳｒＲＮＡ、１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因?qū)χ饕?

病原菌進(jìn)行檢測比較后認(rèn)為在細(xì)菌鑒定中，１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ

可作為比１６ＳｒＲＮＡ 基因更好的分子靶標(biāo)，可 以 在２４ｈ內(nèi) 將

病原菌的種類報告給臨床醫(yī)生。Ｚｈｕ等的 研 究 表 明１６Ｓ～

２３ＳｒＲＮＡ 基因分析 可 以 將１６ＳｒＲＮＡ 序 列 同 源 性 達(dá)９７％的

兩株黏質(zhì)沙雷菌區(qū)分開。根據(jù)１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因間區(qū)兩端

被高 度 保 守 的ｒＲＮＡ 所包圍的結(jié)構(gòu)特點，可 利 用 其 兩 端 １６Ｓ

ｒＲＮＡ 及２３ＳｒＲＮＡ 保守區(qū)設(shè)計通用引物作上、下 游 引 物，特

異性擴增特定細(xì)菌 的１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基 因 間 隔 區(qū)，根 據(jù) 片 段

數(shù)目、長度、序列的多態(tài)性或測序來鑒別微生物。 上海融享生物科技有限公司主營測序包括16s 18S ITS 價格優(yōu)惠。

在過去的十幾年中，下一代測序(NGS)技術(shù)被用于探索各種生態(tài)系統(tǒng)中微生物群落的多樣性和組成結(jié)構(gòu)，對研究海洋、土壤、宿主等環(huán)境中的微生物構(gòu)成有重要的指導(dǎo)作用，同時也是系統(tǒng)發(fā)育和分類學(xué)研究中一種使用的方法，特別是應(yīng)用于不同的環(huán)境宏基因組學(xué)樣本中隨著高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展和參考數(shù)據(jù)庫的不斷更新，利用核糖體操縱子作為 DNA 標(biāo)記可以揭示不同生態(tài)系統(tǒng)中的微生物多樣性和組成。采用第二代高通量測序平臺測定的16S/18S/ITS某個高變區(qū)域的序列，可以反映環(huán)境樣品在細(xì)菌、、古菌等分類方面物種之間的差異。然而，針對不同的環(huán)境樣本，引物的選擇和實驗過程仍然需要更細(xì)致的驗證。

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原 核 生物的ｒＲＮＡ 有３類：５ＳｒＲＮＡ、１６ＳｒＲＮＡ 和２３ＳｒＲＮＡ，其 編

碼基因（ｒＤＮＡ）長度依次為１２０、１５４０及３３００個 核 苷 酸。它

們位于同一操縱子序列中，但被一些間隔區(qū)域所分開，從５′～

３′端 依 次 是：１６Ｓ、間 隔 區(qū)、ｔＲＮＡ、間 隔 區(qū)、２３Ｓ、間 隔 區(qū) 和 ５Ｓ

ｒＲＮＡ［２］，一個操縱子進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后處理成為成熟的１６Ｓ、２３Ｓ和

５ＳｒＲＮＡ。ｒＲＮＡ 結(jié)構(gòu)既具保守性又具高變性，保守性反 映 生

物物種的親緣關(guān)系，高變性則揭示生物物種的特征核酸序列，

是屬種鑒定的分子基礎(chǔ)。因此，可以利用保守區(qū)設(shè)計通用引

物擴增細(xì)菌的相應(yīng)靶序列，再利用可變區(qū)的差異鑒別菌種。其

中以１６ＳｒＲＮＡ 基因及１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因間區(qū)在細(xì)菌鑒定

中的應(yīng)用較為成熟。 江西環(huán)境微生物16S測序機構(gòu)哪家好