標(biāo)準(zhǔn)曲線的各
項指標(biāo):斜率、擴(kuò)增效率(E)、相關(guān)系數(shù)(R2
)、間距均需進(jìn)行
嚴(yán)格評價,從而確保該曲線的可用性。各點間距應(yīng)相等,間
距以及斜率的Absolute 值應(yīng)滿足 3.100~3.582,相關(guān)系數(shù) R2>0.99,
擴(kuò)增效率(E)在 90%~110%之間。擴(kuò)增效率、斜率以及間距
三者相互關(guān)聯(lián),擴(kuò)增效率(E)=10(-1/斜 率 )
-1,斜率的Absolute值恰
是各點之間的平均間距。當(dāng)擴(kuò)增效率<90%時,間距以及 斜
率的Absolute 值會>3.582;當(dāng)擴(kuò)增效率>110%時,間距以及斜率
的Absolute 值會<3.10,故擴(kuò)增效率越低,斜率的Absolute 值越大,間
距越寬;擴(kuò)增效率越高,斜率的Absolute 值越小,間距越窄。擴(kuò)增
效率過低,酶的活性可能出現(xiàn)了問題,或反應(yīng)體系不適合反
應(yīng)的有效進(jìn)行。若擴(kuò)增效率過高,反應(yīng)管內(nèi)可能存在目的基
因擴(kuò)增之外的其他非特異擴(kuò)增,需要對引物進(jìn)行一個溶解
曲線的檢測,優(yōu)化反應(yīng)體系以及反應(yīng)程序。 上海融享生物科技有限公司項目qPCR價格優(yōu)惠。上海SYBRGreen法qPCR哪里有
實時熒光定量 PCR(real-time quantitative
polymerase chain reaction,real-time Q-PCR)技術(shù)于
1996 年由美國 Applied Biosystems 公司推出,由于該
技術(shù)不僅實現(xiàn)了 PCR 從定性到定量的飛躍,而且與常
規(guī) PCR 相比,它具有特異性更強(qiáng)、靈敏度高、重復(fù)性
好、定量準(zhǔn)確、自動化程度高、全封閉反應(yīng)等優(yōu)點成為
分子生物學(xué)研究中的重要工具,目前已得到多應(yīng)用[1]。
實時熒光定量 PCR 的應(yīng)用范圍非常多,包括 mRNA
表達(dá)的研究、DNA 拷貝數(shù)的檢測、單核苷酸多態(tài)性的測
定等[2]。它能對結(jié)核分枝桿菌、乙型、丙型肝炎、愛滋
病、淋球菌、沙眼衣原體等病原體進(jìn)行準(zhǔn)確的定量
檢測。其定量范圍極寬,無需做梯度稀釋,特異性更強(qiáng),
克服了假陽性。 上海SYBRGreen法qPCR哪里有一個好的qPCR項目需要具備哪些特點您了解嗎?
每個模板的 Ct 值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存 在線性關(guān)系 ,起始拷貝數(shù)越多 , Ct 值越小。利用已 知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)樣品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線 ,因此 ,只 要獲得未知樣品的 C t 值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計算出 該樣品的起始拷貝數(shù)。SYBR GreenI 是一種能 結(jié)合到 dsDNA 小溝部位的具有綠色激發(fā)波長的染 料,它只有與 dsDNA 結(jié)合后才會發(fā)出熒光 。在變 性時 ,DNA 雙鏈分開 , 不產(chǎn)生熒光;在復(fù)性和延伸 時,形成 dsDNA , SYBR GreenI 發(fā)出熒光(宋敏等 , 2005 ;張晶等, 2005)。因此,熒光強(qiáng)度可以**擴(kuò)增 產(chǎn)物的數(shù)量。
該探針是長度為 20 ~ 24 bp 的寡核苷酸,在其 5' 末端標(biāo)記 1 個熒光報告基團(tuán),3'末端標(biāo)記 1 個熒光淬 滅基團(tuán),其序列與 2 個引物包含序列內(nèi)的 1 段 DNA 模板完全互補(bǔ)。該方法是當(dāng)探針保持完整時利用 Taq 酶( 5'→3'外切酶) 的活性淬滅基團(tuán)吸收發(fā)射的 熒光。當(dāng)有特異的而不是非特異的 PCR 發(fā)生時,Taq 酶同時發(fā)揮其 5'→3'外切酶活性,將與模板雜交的探 針切碎,報告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,淬滅作用被解除, 熒光信號釋放,通過檢測系統(tǒng)就可以觀察到信號的變 化,熒光信號的累積與 PCR 產(chǎn)物形成呈正相關(guān)。上海融享生物科技有限公司主做的qPCR。
在熒光定量 PCR 技術(shù)中,有一個很重要的概念—
—Ct 值。C 表示 Cycle(循環(huán)),t 表示 threshold(閾值),
Ct 值的含義是:每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達(dá)設(shè)定的域
值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù),
熒光域值(threshold)的設(shè)定:PCR 反應(yīng)的前 15 個
循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號,熒光域值的缺省設(shè)
置是 3~15 個循環(huán)的熒光信號標(biāo)準(zhǔn)偏差的 10 倍,即:
threshold = 10 ’SDcycle 6-15。
Ct 值與起始模板的關(guān)系:研究表明,每個模板的
Ct 值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關(guān)系,起始
拷貝數(shù)越多,Ct 值越小[5-6]。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)
準(zhǔn)品可做出標(biāo)準(zhǔn)曲線,其中橫坐標(biāo)表示起始拷貝數(shù)的對
數(shù),縱坐標(biāo)表示 Ct 值。因此,只要獲得未知樣品的 Ct
值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計算出該樣品的起始拷貝數(shù)
那么qPCR的優(yōu)勢都有哪些呢?上海SYBRGreen法qPCR哪里有
上海融享生物科技有限公司qPCR的上乘。上海SYBRGreen法qPCR哪里有
實時熒光定量 PCR 技術(shù)的分類:熒光探針法:水解探針法。水解探針的結(jié)構(gòu)特點是寡核苷酸序列
的 5′端為熒光報告基團(tuán),3′端 為 熒 光 淬 滅 基 團(tuán)。PCR 擴(kuò) 增
前,探針游離于靶序列外,報告基團(tuán)發(fā)出的熒光被淬滅基團(tuán)
吸收,檢測不到熒光,但有時會因淬滅不徹底,會檢測到微
弱的熒光。在 PCR 退火時,探針特異性地結(jié)合到靶序列上,
在延伸階段,利用 Taq 酶 5′-3′外切酶的活性將探針?biāo)猓?
熒光報告基團(tuán)與熒光淬滅基團(tuán)分離,熒光信號被釋放,并與
PCR 產(chǎn)物的數(shù)量成正相關(guān)。由于水解探針的作用機(jī)理依賴
于 Taq 酶 5′-3′外切酶的活性,所以水解探針又稱為 Taqman
探針。 上海SYBRGreen法qPCR哪里有